RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa5.65□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.513e-6■■□□□ 13.2
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 HECW1Q76N89 1606 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 MAGI2Q86UL8 1455 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 AKNAQ7Z591 1439 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 CFAP74Q9C0B2 1584 aa5.64□□□□□ -1.51
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ANKRD28-202ENST00000412318 CHMP4AQ9BY43 222 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 C9orf84Q5VXU9 1444 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 MIA2Q96PC5 1412 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 PIP4K2BP78356 416 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 COG3Q96JB2 828 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 ABCA9Q8IUA7 1624 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 CPS1P31327 1500 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 APPP05067 770 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 MSNP26038 577 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 VSIG10Q8N0Z9 540 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 RSPH6AQ9H0K4 717 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 DEKP35659 375 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP6R1Q9UPN7 881 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.62□□□□□ -1.511e-6■■■■□ 24.5
ANKRD28-202ENST00000412318 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC26A8Q96RN1 970 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 NCOA1Q15788 1441 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA0556O60303 1618 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 FANCIQ9NVI1 1328 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 GPRASP1Q5JY77 1395 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 PDE4CQ08493 712 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 ESCO1Q5FWF5 840 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 USP35Q9P2H5 1018 aa5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 HSPA2P54652 639 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 SETQ01105 290 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA2Q08379 1002 aa5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 PLA2R1Q13018 1463 aa5.59□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM132EQ6IEE7 984 aa5.59□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 RICTORQ6R327 1708 aa5.59□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 MSH5O43196 834 aa5.59□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
ANKRD28-202ENST00000412318 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 PTPRKQ15262 1439 aa5.59□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 CGNL1Q0VF96 1302 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC141Q6ZP82 1450 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 DCAF8L1A6NGE4 600 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 C1orf141Q5JVX7 400 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 REREQ9P2R6 1566 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 HFM1A2PYH4 1435 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 NLRP6P59044 892 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 MS4A1P11836 297 aa5.58□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 UGGT2Q9NYU1 1516 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 RALBP1Q15311 655 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 CFAP70Q5T0N1 1121 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 KIF14Q15058 1648 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 LMOD3Q0VAK6 560 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 UBAP1LF5GYI3 381 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 NLRP2Q9NX02 1062 aa5.57□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 TOM1O60784 492 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 ABTB2Q8N961 1025 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 TEFQ10587 303 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 IFFO2Q5TF58 517 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 PRAM1Q96QH2 718 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 STK31Q9BXU1 1019 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA2012Q0VF49 1180 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 NUTM2GQ5VZR2 741 aa5.56□□□□□ -1.52
ANKRD28-202ENST00000412318 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa5.56□□□□□ -1.52
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