RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410466.1

RNU6-554P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 554, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-554P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-554P-201ENST00000410466 GMPRP36959 345 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 TRIM47Q96LD4 638 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 PRR14Q9BWN1 585 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 PKD2L1Q9P0L9 805 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 PNMA3Q9UL41 463 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 SLF2Q8IX21 1173 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 CYP4X1Q8N118 509 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 TATDN2Q93075 761 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 CDCA7LQ96GN5 454 aa4.93□□□□□ -1.62
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RNU6-554P-201ENST00000410466 SLC4A3P48751 1232 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 XP32Q5T750 250 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 IRF7Q92985 503 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 TOR4AQ9NXH8 423 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 PRSS12P56730 875 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-554P-201ENST00000410466 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.91□□□□□ -1.62
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RNU6-554P-201ENST00000410466 KIFC2Q96AC6 838 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 KCNMA1Q12791 1236 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 PLA2G2CQ5R387 149 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 DDX12PQ92771 950 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 FAM198AQ9UFP1 575 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 C3orf80F5H4A9 247 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 NBR1Q14596 966 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 MFSD10Q14728 455 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 HS6ST3Q8IZP7 471 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 TMEM151AQ8N4L1 468 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 CERKQ8TCT0 537 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 ADH1BP00325 375 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 NUDT18Q6ZVK8 323 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 GDF11O95390 407 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 SLC6A16Q9GZN6 736 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 RPIAP49247 311 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 GSK3AP49840 483 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-554P-201ENST00000410466 DPYSL4O14531 572 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-554P-201ENST00000410466 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-554P-201ENST00000410466 H3BM21 787 aa4.82□□□□□ -1.64
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RNU6-554P-201ENST00000410466 RASSF7Q02833 373 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-554P-201ENST00000410466 ERBB4Q15303 1308 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-554P-201ENST00000410466 VEGFBP49765 207 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-554P-201ENST00000410466 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-554P-201ENST00000410466 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
RNU6-554P-201ENST00000410466 NR1I2O75469 434 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-554P-201ENST00000410466 SMPD1P17405 629 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-554P-201ENST00000410466 PKD2Q13563 968 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-554P-201ENST00000410466 KMT5BQ4FZB7 885 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-554P-201ENST00000410466 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-554P-201ENST00000410466 GPAT2Q6NUI2 795 aa4.79□□□□□ -1.64
RNU6-554P-201ENST00000410466 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.79□□□□□ -1.64
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RNU6-554P-201ENST00000410466 IGHA1P01876 353 aa4.78□□□□□ -1.64
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RNU6-554P-201ENST00000410466 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.76□□□□□ -1.65
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RNU6-554P-201ENST00000410466 SPSB2Q99619 263 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-554P-201ENST00000410466 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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RNU6-554P-201ENST00000410466 WNT7AO00755 349 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-554P-201ENST00000410466 CFHP08603 1231 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-554P-201ENST00000410466 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa4.74□□□□□ -1.65
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RNU6-554P-201ENST00000410466 PADI6Q6TGC4 694 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-554P-201ENST00000410466 PDIA6Q15084 440 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-554P-201ENST00000410466 TTC13Q8NBP0 860 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-554P-201ENST00000410466 CDHR5Q9HBB8 845 aa4.72□□□□□ -1.65
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RNU6-554P-201ENST00000410466 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 EYA1Q99502 592 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 ADAM23O75077 832 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 BMP1P13497 986 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 DNAJB2P25686 324 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 MRGPRX2Q96LB1 330 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 ADAMTS8Q9UP79 889 aa4.69□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 GRXCR2A6NFK2 248 aa4.68□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 IRS1P35568 1242 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 TRIM32Q13049 653 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 LCE3BQ5TA77 95 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 TRIM46Q7Z4K8 759 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 TMEM134Q9H6X4 195 aa4.67□□□□□ -1.66
RNU6-554P-201ENST00000410466 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
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