RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.49■■■□□ 2.15
ODC1-202ENST00000405333 TNRQ92752 1358 aa28.49■■■□□ 2.15
ODC1-202ENST00000405333 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.47■■■□□ 2.15
ODC1-202ENST00000405333 USP47Q96K76 1375 aa28.46■■■□□ 2.15
ODC1-202ENST00000405333 STAC3Q96MF2 364 aa28.45■■■□□ 2.15
ODC1-202ENST00000405333 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.44■■■□□ 2.14
ODC1-202ENST00000405333 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.44■■■□□ 2.14
ODC1-202ENST00000405333 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
ODC1-202ENST00000405333 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.43■■■□□ 2.14
ODC1-202ENST00000405333 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.43■■■□□ 2.14
ODC1-202ENST00000405333 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.42■■■□□ 2.14
ODC1-202ENST00000405333 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
ODC1-202ENST00000405333 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.4■■■□□ 2.14
ODC1-202ENST00000405333 PIK3C2GO75747 1445 aa28.39■■■□□ 2.13
ODC1-202ENST00000405333 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.36■■■□□ 2.13
ODC1-202ENST00000405333 LAMC1P11047 1609 aa28.36■■■□□ 2.13
ODC1-202ENST00000405333 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.36■■■□□ 2.13
ODC1-202ENST00000405333 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
ODC1-202ENST00000405333 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
ODC1-202ENST00000405333 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.33■■■□□ 2.13
ODC1-202ENST00000405333 NLRP1Q9C000 1473 aa28.31■■■□□ 2.12
ODC1-202ENST00000405333 ZFYVE9O95405 1425 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-202ENST00000405333 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-202ENST00000405333 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.3■■■□□ 2.12
ODC1-202ENST00000405333 IQGAP1P46940 1657 aa28.29■■■□□ 2.12
ODC1-202ENST00000405333 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.29■■■□□ 2.12
ODC1-202ENST00000405333 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
ODC1-202ENST00000405333 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
ODC1-202ENST00000405333 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
ODC1-202ENST00000405333 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.26■■■□□ 2.11
ODC1-202ENST00000405333 ADGRB1O14514 1584 aa28.24■■■□□ 2.11
ODC1-202ENST00000405333 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
ODC1-202ENST00000405333 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.22■■■□□ 2.11
ODC1-202ENST00000405333 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.22■■■□□ 2.11
ODC1-202ENST00000405333 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
ODC1-202ENST00000405333 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.21■■■□□ 2.11
ODC1-202ENST00000405333 CCDC7Q96M83 1385 aa28.21■■■□□ 2.11
ODC1-202ENST00000405333 PTPRMP28827 1452 aa28.21■■■□□ 2.11
ODC1-202ENST00000405333 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.18■■■□□ 2.1
ODC1-202ENST00000405333 TESK2Q96S53 571 aa28.18■■■□□ 2.1
ODC1-202ENST00000405333 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
ODC1-202ENST00000405333 ALKQ9UM73 1620 aa28.17■■■□□ 2.1
ODC1-202ENST00000405333 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.16■■■□□ 2.1
ODC1-202ENST00000405333 LTKP29376 864 aa28.16■■■□□ 2.1
ODC1-202ENST00000405333 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.14■■■□□ 2.1
ODC1-202ENST00000405333 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.09
ODC1-202ENST00000405333 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.13■■■□□ 2.09
ODC1-202ENST00000405333 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
ODC1-202ENST00000405333 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
ODC1-202ENST00000405333 SLIT1O75093 1534 aa28.11■■■□□ 2.09
ODC1-202ENST00000405333 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.1■■■□□ 2.09
ODC1-202ENST00000405333 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.1■■■□□ 2.09
ODC1-202ENST00000405333 MIER1Q8N108 512 aa28.1■■■□□ 2.09
ODC1-202ENST00000405333 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
ODC1-202ENST00000405333 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
ODC1-202ENST00000405333 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.09■■■□□ 2.09
ODC1-202ENST00000405333 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
ODC1-202ENST00000405333 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
ODC1-202ENST00000405333 STK26Q9P289 416 aa28.08■■■□□ 2.09
ODC1-202ENST00000405333 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
ODC1-202ENST00000405333 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.05■■■□□ 2.08
ODC1-202ENST00000405333 BCANQ96GW7 911 aa28.05■■■□□ 2.08
ODC1-202ENST00000405333 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
ODC1-202ENST00000405333 EID1Q9Y6B2 187 aa28.03■■■□□ 2.08
ODC1-202ENST00000405333 METP08581 1390 aa28.02■■■□□ 2.08
ODC1-202ENST00000405333 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.02■■■□□ 2.08
ODC1-202ENST00000405333 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.01■■■□□ 2.07
ODC1-202ENST00000405333 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.01■■■□□ 2.07
ODC1-202ENST00000405333 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
ODC1-202ENST00000405333 TMF1P82094 1093 aa28■■■□□ 2.07
ODC1-202ENST00000405333 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.97■■■□□ 2.07
ODC1-202ENST00000405333 SLC26A8Q96RN1 970 aa27.97■■■□□ 2.07
ODC1-202ENST00000405333 MED14O60244 1454 aa27.93■■■□□ 2.06
ODC1-202ENST00000405333 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
ODC1-202ENST00000405333 PRAM1Q96QH2 718 aa27.92■■■□□ 2.06
ODC1-202ENST00000405333 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.91■■■□□ 2.06
ODC1-202ENST00000405333 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.88■■■□□ 2.05
ODC1-202ENST00000405333 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.88■■■□□ 2.05
ODC1-202ENST00000405333 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.88■■■□□ 2.05
ODC1-202ENST00000405333 ABCC11Q96J66 1382 aa27.87■■■□□ 2.05
ODC1-202ENST00000405333 POGKQ9P215 609 aa27.86■■■□□ 2.05
ODC1-202ENST00000405333 DLC1Q96QB1 1528 aa27.85■■■□□ 2.05
ODC1-202ENST00000405333 PTPRUQ92729 1446 aa27.85■■■□□ 2.05
ODC1-202ENST00000405333 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.85■■■□□ 2.05
ODC1-202ENST00000405333 MYOM1P52179 1685 aa27.84■■■□□ 2.05
ODC1-202ENST00000405333 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
ODC1-202ENST00000405333 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.84■■■□□ 2.05
ODC1-202ENST00000405333 TBX22Q9Y458 520 aa27.82■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 CDCA8Q53HL2 280 aa27.81■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 TECPR2O15040 1411 aa27.81■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 ANP32CO43423 234 aa27.8■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.8■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 DIP2AQ14689 1571 aa27.8■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 CPS1P31327 1500 aa27.8■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 ROBO2Q9HCK4 1378 aa27.8■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 SLC24A1O60721 1099 aa27.78■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 HSPA2P54652 639 aa27.77■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 PANK3Q9H999 370 aa27.77■■■□□ 2.04
ODC1-202ENST00000405333 EVC2Q86UK5 1308 aa27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms