RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
ATG4B-204ENST00000402096 CARD11Q9BXL7 1154 aa28.94■■■□□ 2.22
ATG4B-204ENST00000402096 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa28.92■■■□□ 2.22
ATG4B-204ENST00000402096 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.9■■■□□ 2.22
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.89■■■□□ 2.22
ATG4B-204ENST00000402096 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.88■■■□□ 2.21
ATG4B-204ENST00000402096 LAMC1P11047 1609 aa28.88■■■□□ 2.21
ATG4B-204ENST00000402096 USP47Q96K76 1375 aa28.88■■■□□ 2.21
ATG4B-204ENST00000402096 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
ATG4B-204ENST00000402096 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.86■■■□□ 2.21
ATG4B-204ENST00000402096 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.86■■■□□ 2.21
ATG4B-204ENST00000402096 VGFO15240 615 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
ATG4B-204ENST00000402096 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.84■■■□□ 2.21
ATG4B-204ENST00000402096 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.83■■■□□ 2.21
ATG4B-204ENST00000402096 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
ATG4B-204ENST00000402096 NLRP1Q9C000 1473 aa28.83■■■□□ 2.21
ATG4B-204ENST00000402096 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
ATG4B-204ENST00000402096 PIK3C2GO75747 1445 aa28.8■■■□□ 2.2
ATG4B-204ENST00000402096 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.8■■■□□ 2.2
ATG4B-204ENST00000402096 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.79■■■□□ 2.2
ATG4B-204ENST00000402096 ZFYVE9O95405 1425 aa28.78■■■□□ 2.2
ATG4B-204ENST00000402096 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.77■■■□□ 2.2
ATG4B-204ENST00000402096 IQGAP1P46940 1657 aa28.76■■■□□ 2.19
ATG4B-204ENST00000402096 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
ATG4B-204ENST00000402096 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
ATG4B-204ENST00000402096 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
ATG4B-204ENST00000402096 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.71■■■□□ 2.19
ATG4B-204ENST00000402096 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.7■■■□□ 2.19
ATG4B-204ENST00000402096 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP28.69■■■□□ 2.18
ATG4B-204ENST00000402096 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
ATG4B-204ENST00000402096 HDGFP51858 240 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.67■■■□□ 2.18
ATG4B-204ENST00000402096 PTPRMP28827 1452 aa28.67■■■□□ 2.18
ATG4B-204ENST00000402096 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
ATG4B-204ENST00000402096 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
ATG4B-204ENST00000402096 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
ATG4B-204ENST00000402096 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.63■■■□□ 2.17
ATG4B-204ENST00000402096 ADGRB1O14514 1584 aa28.63■■■□□ 2.17
ATG4B-204ENST00000402096 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
ATG4B-204ENST00000402096 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.62■■■□□ 2.17
ATG4B-204ENST00000402096 ALKQ9UM73 1620 aa28.61■■■□□ 2.17
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC7Q96M83 1385 aa28.61■■■□□ 2.17
ATG4B-204ENST00000402096 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
ATG4B-204ENST00000402096 BCANQ96GW7 911 aa28.58■■■□□ 2.16
ATG4B-204ENST00000402096 SLIT1O75093 1534 aa28.57■■■□□ 2.16
ATG4B-204ENST00000402096 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.57■■■□□ 2.16
ATG4B-204ENST00000402096 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.57■■■□□ 2.16
ATG4B-204ENST00000402096 EID1Q9Y6B2 187 aa28.57■■■□□ 2.16
ATG4B-204ENST00000402096 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa28.57■■■□□ 2.16
ATG4B-204ENST00000402096 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa28.56■■■□□ 2.16
ATG4B-204ENST00000402096 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.55■■■□□ 2.16
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.55■■■□□ 2.16
ATG4B-204ENST00000402096 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
ATG4B-204ENST00000402096 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.54■■■□□ 2.16
ATG4B-204ENST00000402096 LTKP29376 864 aa28.52■■■□□ 2.16
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
ATG4B-204ENST00000402096 TESK2Q96S53 571 aa28.51■■■□□ 2.16
ATG4B-204ENST00000402096 STK26Q9P289 416 aa28.49■■■□□ 2.15
ATG4B-204ENST00000402096 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.49■■■□□ 2.15
ATG4B-204ENST00000402096 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa28.49■■■□□ 2.15
ATG4B-204ENST00000402096 TMF1P82094 1093 aa28.48■■■□□ 2.15
ATG4B-204ENST00000402096 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
ATG4B-204ENST00000402096 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
ATG4B-204ENST00000402096 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.46■■■□□ 2.15
ATG4B-204ENST00000402096 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.42■■■□□ 2.14
ATG4B-204ENST00000402096 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa28.41■■■□□ 2.14
ATG4B-204ENST00000402096 MIER1Q8N108 512 aa28.4■■■□□ 2.14
ATG4B-204ENST00000402096 METP08581 1390 aa28.4■■■□□ 2.14
ATG4B-204ENST00000402096 SLC24A1O60721 1099 aa28.38■■■□□ 2.13
ATG4B-204ENST00000402096 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.38■■■□□ 2.13
ATG4B-204ENST00000402096 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
ATG4B-204ENST00000402096 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.37■■■□□ 2.13
ATG4B-204ENST00000402096 CDCA8Q53HL2 280 aa28.36■■■□□ 2.13
ATG4B-204ENST00000402096 SLC26A8Q96RN1 970 aa28.36■■■□□ 2.13
ATG4B-204ENST00000402096 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.36■■■□□ 2.13
ATG4B-204ENST00000402096 POGKQ9P215 609 aa28.35■■■□□ 2.13
ATG4B-204ENST00000402096 DIP2AQ14689 1571 aa28.35■■■□□ 2.13
ATG4B-204ENST00000402096 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
ATG4B-204ENST00000402096 DLC1Q96QB1 1528 aa28.34■■■□□ 2.13
ATG4B-204ENST00000402096 PRAM1Q96QH2 718 aa28.33■■■□□ 2.13
ATG4B-204ENST00000402096 MED14O60244 1454 aa28.33■■■□□ 2.13
ATG4B-204ENST00000402096 ABCC11Q96J66 1382 aa28.31■■■□□ 2.12
ATG4B-204ENST00000402096 TBX22Q9Y458 520 aa28.29■■■□□ 2.12
ATG4B-204ENST00000402096 ANP32CO43423 234 aa28.28■■■□□ 2.12
ATG4B-204ENST00000402096 CPS1P31327 1500 aa28.28■■■□□ 2.12
ATG4B-204ENST00000402096 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
ATG4B-204ENST00000402096 MYOM1P52179 1685 aa28.25■■■□□ 2.11
ATG4B-204ENST00000402096 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.25■■■□□ 2.11
ATG4B-204ENST00000402096 EVC2Q86UK5 1308 aa28.24■■■□□ 2.11
ATG4B-204ENST00000402096 TECPR2O15040 1411 aa28.24■■■□□ 2.11
ATG4B-204ENST00000402096 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.24■■■□□ 2.11
ATG4B-204ENST00000402096 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
ATG4B-204ENST00000402096 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.23■■■□□ 2.11
ATG4B-204ENST00000402096 PTPRUQ92729 1446 aa28.22■■■□□ 2.11
ATG4B-204ENST00000402096 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.22■■■□□ 2.11
ATG4B-204ENST00000402096 FAM135BQ49AJ0 1406 aa28.2■■■□□ 2.11
ATG4B-204ENST00000402096 SIRT1Q96EB6 747 aa28.19■■■□□ 2.1
ATG4B-204ENST00000402096 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa28.19■■■□□ 2.1
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