RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383791.7

SH3BP5-202, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP5, Length 2,822 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-202ENST00000383791 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP5-202ENST00000383791 BCAR3O75815 825 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP5-202ENST00000383791 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP5-202ENST00000383791 APAF1O14727 1248 aa21.61■■□□□ 1.05
SH3BP5-202ENST00000383791 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP5-202ENST00000383791 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP5-202ENST00000383791 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP5-202ENST00000383791 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SH3BP5-202ENST00000383791 UNC13BO14795 1591 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP5-202ENST00000383791 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP5-202ENST00000383791 IGHDP01880 384 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP5-202ENST00000383791 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP5-202ENST00000383791 SLFN5Q08AF3 891 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP5-202ENST00000383791 ARXQ96QS3 562 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP5-202ENST00000383791 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP5-202ENST00000383791 SEC24BO95487 1268 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP5-202ENST00000383791 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP5-202ENST00000383791 NEUROD2Q15784 382 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP5-202ENST00000383791 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP5-202ENST00000383791 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP5-202ENST00000383791 ZNF521Q96K83 1311 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP5-202ENST00000383791 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP5-202ENST00000383791 POGKQ9P215 609 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP5-202ENST00000383791 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP5-202ENST00000383791 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BP5-202ENST00000383791 PANK1Q8TE04 598 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP5-202ENST00000383791 COG6Q9Y2V7 657 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP5-202ENST00000383791 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SH3BP5-202ENST00000383791 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP5-202ENST00000383791 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP5-202ENST00000383791 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BP5-202ENST00000383791 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP5-202ENST00000383791 KIF3BO15066 747 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP5-202ENST00000383791 LAMC1P11047 1609 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP5-202ENST00000383791 INSRP06213 1382 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 USP19O94966 1318 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 CDCA8Q53HL2 280 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 ATP10AO60312 1499 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 PLXNC1O60486 1568 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 PLCH2O75038 1416 aa21.43■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 MADDQ8WXG6 1647 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 CHD1O14646 1710 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 BCL2L13Q9BXK5 485 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 TNNQ9UQP3 1299 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.4■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
SH3BP5-202ENST00000383791 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 ABCC2Q92887 1545 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 E9PSI1 815 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 IQGAP1P46940 1657 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 CLTCL1P53675 1640 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 PIK3C2GO75747 1445 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 WWC1Q8IX03 1113 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 SYNMO15061 1565 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP5-202ENST00000383791 BECN1Q14457 450 aa21.33■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 ABCC1P33527 1531 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 MYOM1P52179 1685 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 CGNL1Q0VF96 1302 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 TRPM2O94759 1503 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 ERVK-7P63135 1459 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 RLBP1P12271 317 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 MORC1Q86VD1 984 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 PTPRTO14522 1441 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 PDE3AQ14432 1141 aa21.28■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP5-202ENST00000383791 TCP11L2Q8N4U5 519 aa21.27■□□□□ 0.99
SH3BP5-202ENST00000383791 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.27■□□□□ 0.99
SH3BP5-202ENST00000383791 KANK1Q14678 1352 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP5-202ENST00000383791 TBC1D2Q9BYX2 928 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP5-202ENST00000383791 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
SH3BP5-202ENST00000383791 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.25■□□□□ 0.99
SH3BP5-202ENST00000383791 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SH3BP5-202ENST00000383791 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5-202ENST00000383791 CEP152O94986 1710 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP5-202ENST00000383791 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-202ENST00000383791 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-202ENST00000383791 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-202ENST00000383791 MTHFSP49914 203 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-202ENST00000383791 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SH3BP5-202ENST00000383791 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms