RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380283.4

PXDC1-202, Transcript of PX domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXDC1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1-202ENST00000380283 RGL3Q3MIN7 710 aa35.42■■■■□ 3.26
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PXDC1-202ENST00000380283 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
PXDC1-202ENST00000380283 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.4■■■■□ 3.26
PXDC1-202ENST00000380283 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.4■■■■□ 3.26
PXDC1-202ENST00000380283 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.39■■■■□ 3.26
PXDC1-202ENST00000380283 MLECQ14165 292 aa35.37■■■■□ 3.25
PXDC1-202ENST00000380283 TMC1Q8TDI8 760 aa35.37■■■■□ 3.25
PXDC1-202ENST00000380283 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
PXDC1-202ENST00000380283 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
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PXDC1-202ENST00000380283 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.35■■■■□ 3.25
PXDC1-202ENST00000380283 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
PXDC1-202ENST00000380283 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.35■■■■□ 3.25
PXDC1-202ENST00000380283 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.34■■■■□ 3.25
PXDC1-202ENST00000380283 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.25
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PXDC1-202ENST00000380283 NOS1P29475 1434 aa35.27■■■■□ 3.24
PXDC1-202ENST00000380283 CARD11Q9BXL7 1154 aa35.26■■■■□ 3.24
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PXDC1-202ENST00000380283 NBR1Q14596 966 aa35.2■■■■□ 3.23
PXDC1-202ENST00000380283 RRP1P56182 461 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.22
PXDC1-202ENST00000380283 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
PXDC1-202ENST00000380283 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
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PXDC1-202ENST00000380283 KIF1BO60333 1816 aa35.17■■■■□ 3.22
PXDC1-202ENST00000380283 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.16■■■■□ 3.22
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PXDC1-202ENST00000380283 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.15■■■■□ 3.22
PXDC1-202ENST00000380283 PREX1Q8TCU6 1659 aa35.13■■■■□ 3.21
PXDC1-202ENST00000380283 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
PXDC1-202ENST00000380283 PDE3BQ13370 1112 aa35.11■■■■□ 3.21
PXDC1-202ENST00000380283 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.11■■■■□ 3.21
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PXDC1-202ENST00000380283 STAC3Q96MF2 364 aa35.11■■■■□ 3.21
PXDC1-202ENST00000380283 IDI1Q13907 227 aa35.1■■■■□ 3.21
PXDC1-202ENST00000380283 PARD3Q8TEW0 1356 aa35.1■■■■□ 3.21
PXDC1-202ENST00000380283 PIK3C2BO00750 1634 aa35.09■■■■□ 3.21
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PXDC1-202ENST00000380283 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.07■■■■□ 3.2
PXDC1-202ENST00000380283 ADGRB3O60242 1522 aa35.07■■■■□ 3.2
PXDC1-202ENST00000380283 NLRP13Q86W25 1043 aa35.07■■■■□ 3.2
PXDC1-202ENST00000380283 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa35.06■■■■□ 3.2
PXDC1-202ENST00000380283 MROH2AA6NES4 1674 aa35.06■■■■□ 3.2
PXDC1-202ENST00000380283 EXOC6Q8TAG9 804 aa35.06■■■■□ 3.2
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PXDC1-202ENST00000380283 TNRQ92752 1358 aa34.82■■■■□ 3.16
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PXDC1-202ENST00000380283 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP34.81■■■■□ 3.16
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PXDC1-202ENST00000380283 PIK3C2GO75747 1445 aa34.76■■■■□ 3.15
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PXDC1-202ENST00000380283 ZFYVE9O95405 1425 aa34.73■■■■□ 3.15
PXDC1-202ENST00000380283 DISP3Q9P2K9 1392 aa34.72■■■■□ 3.15
PXDC1-202ENST00000380283 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP34.72■■■■□ 3.15
PXDC1-202ENST00000380283 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP34.69■■■■□ 3.14
PXDC1-202ENST00000380283 CRBNQ96SW2 442 aa34.66■■■■□ 3.14
PXDC1-202ENST00000380283 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.65■■■■□ 3.14
PXDC1-202ENST00000380283 PLIN1O60240 522 aa34.64■■■■□ 3.14
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PXDC1-202ENST00000380283 ADAMTSL3P82987 1691 aa34.64■■■■□ 3.14
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