RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.91■■□□□ 1.9
PRRT1-202ENST00000375150 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.9■■□□□ 1.9
PRRT1-202ENST00000375150 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.89■■□□□ 1.89
PRRT1-202ENST00000375150 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PRRT1-202ENST00000375150 NRXN1Q9ULB1 1477 aa26.87■■□□□ 1.89
PRRT1-202ENST00000375150 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PRRT1-202ENST00000375150 ZFYVE9O95405 1425 aa26.85■■□□□ 1.89
PRRT1-202ENST00000375150 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
PRRT1-202ENST00000375150 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa26.83■■□□□ 1.89
PRRT1-202ENST00000375150 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa26.83■■□□□ 1.89
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.88
PRRT1-202ENST00000375150 RIMS2Q9UQ26 1411 aa26.82■■□□□ 1.88
PRRT1-202ENST00000375150 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PRRT1-202ENST00000375150 PIK3C2GO75747 1445 aa26.8■■□□□ 1.88
PRRT1-202ENST00000375150 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.78■■□□□ 1.88
PRRT1-202ENST00000375150 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PRRT1-202ENST00000375150 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP26.78■■□□□ 1.88
PRRT1-202ENST00000375150 LAMC1P11047 1609 aa26.78■■□□□ 1.88
PRRT1-202ENST00000375150 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.76■■□□□ 1.88
PRRT1-202ENST00000375150 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.88
PRRT1-202ENST00000375150 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.76■■□□□ 1.87
PRRT1-202ENST00000375150 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PRRT1-202ENST00000375150 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.75■■□□□ 1.87
PRRT1-202ENST00000375150 SLIT1O75093 1534 aa26.74■■□□□ 1.87
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PRRT1-202ENST00000375150 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.73■■□□□ 1.87
PRRT1-202ENST00000375150 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.72■■□□□ 1.87
PRRT1-202ENST00000375150 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.72■■□□□ 1.87
PRRT1-202ENST00000375150 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa26.7■■□□□ 1.86
PRRT1-202ENST00000375150 CFAP70Q5T0N1 1121 aa26.7■■□□□ 1.86
PRRT1-202ENST00000375150 USP47Q96K76 1375 aa26.7■■□□□ 1.86
PRRT1-202ENST00000375150 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PRRT1-202ENST00000375150 EID1Q9Y6B2 187 aa26.68■■□□□ 1.86
PRRT1-202ENST00000375150 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
PRRT1-202ENST00000375150 IQGAP1P46940 1657 aa26.64■■□□□ 1.86
PRRT1-202ENST00000375150 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.63■■□□□ 1.85
PRRT1-202ENST00000375150 ALKQ9UM73 1620 aa26.63■■□□□ 1.85
PRRT1-202ENST00000375150 ADGRB1O14514 1584 aa26.63■■□□□ 1.85
PRRT1-202ENST00000375150 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PRRT1-202ENST00000375150 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa26.62■■□□□ 1.85
PRRT1-202ENST00000375150 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa26.61■■□□□ 1.85
PRRT1-202ENST00000375150 LTKP29376 864 aa26.61■■□□□ 1.85
PRRT1-202ENST00000375150 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PRRT1-202ENST00000375150 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PRRT1-202ENST00000375150 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
PRRT1-202ENST00000375150 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PRRT1-202ENST00000375150 BCANQ96GW7 911 aa26.56■■□□□ 1.84
PRRT1-202ENST00000375150 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa26.56■■□□□ 1.84
PRRT1-202ENST00000375150 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.56■■□□□ 1.84
PRRT1-202ENST00000375150 TMEM132EQ6IEE7 984 aa26.54■■□□□ 1.84
PRRT1-202ENST00000375150 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.53■■□□□ 1.84
PRRT1-202ENST00000375150 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PRRT1-202ENST00000375150 DIP2AQ14689 1571 aa26.52■■□□□ 1.84
PRRT1-202ENST00000375150 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa26.51■■□□□ 1.83
PRRT1-202ENST00000375150 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
PRRT1-202ENST00000375150 MED14O60244 1454 aa26.48■■□□□ 1.83
PRRT1-202ENST00000375150 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PRRT1-202ENST00000375150 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.46■■□□□ 1.83
PRRT1-202ENST00000375150 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.46■■□□□ 1.83
PRRT1-202ENST00000375150 METP08581 1390 aa26.45■■□□□ 1.82
PRRT1-202ENST00000375150 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
PRRT1-202ENST00000375150 TBX22Q9Y458 520 aa26.44■■□□□ 1.82
PRRT1-202ENST00000375150 SLC26A8Q96RN1 970 aa26.42■■□□□ 1.82
PRRT1-202ENST00000375150 STK26Q9P289 416 aa26.42■■□□□ 1.82
PRRT1-202ENST00000375150 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PRRT1-202ENST00000375150 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
PRRT1-202ENST00000375150 KNDC1Q76NI1 1749 aa26.41■■□□□ 1.82
PRRT1-202ENST00000375150 DLC1Q96QB1 1528 aa26.41■■□□□ 1.82
PRRT1-202ENST00000375150 TESK2Q96S53 571 aa26.41■■□□□ 1.82
PRRT1-202ENST00000375150 QRICH2Q9H0J4 1663 aa26.4■■□□□ 1.82
PRRT1-202ENST00000375150 ABCC11Q96J66 1382 aa26.4■■□□□ 1.82
PRRT1-202ENST00000375150 SLC24A1O60721 1099 aa26.39■■□□□ 1.82
PRRT1-202ENST00000375150 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa26.39■■□□□ 1.81
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC7Q96M83 1385 aa26.38■■□□□ 1.81
PRRT1-202ENST00000375150 TECPR2O15040 1411 aa26.37■■□□□ 1.81
PRRT1-202ENST00000375150 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.37■■□□□ 1.81
PRRT1-202ENST00000375150 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.37■■□□□ 1.81
PRRT1-202ENST00000375150 PIK3R4Q99570 1358 aa26.37■■□□□ 1.81
PRRT1-202ENST00000375150 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PRRT1-202ENST00000375150 HSPA2P54652 639 aa26.36■■□□□ 1.81
PRRT1-202ENST00000375150 TMF1P82094 1093 aa26.36■■□□□ 1.81
PRRT1-202ENST00000375150 CPS1P31327 1500 aa26.36■■□□□ 1.81
PRRT1-202ENST00000375150 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.35■■□□□ 1.81
PRRT1-202ENST00000375150 POGKQ9P215 609 aa26.33■■□□□ 1.81
PRRT1-202ENST00000375150 PRAM1Q96QH2 718 aa26.32■■□□□ 1.8
PRRT1-202ENST00000375150 FAM135BQ49AJ0 1406 aa26.31■■□□□ 1.8
PRRT1-202ENST00000375150 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.31■■□□□ 1.8
PRRT1-202ENST00000375150 PTPRUQ92729 1446 aa26.31■■□□□ 1.8
PRRT1-202ENST00000375150 SIRT1Q96EB6 747 aa26.31■■□□□ 1.8
PRRT1-202ENST00000375150 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PRRT1-202ENST00000375150 CDCA8Q53HL2 280 aa26.3■■□□□ 1.8
PRRT1-202ENST00000375150 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PRRT1-202ENST00000375150 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PRRT1-202ENST00000375150 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa26.28■■□□□ 1.8
PRRT1-202ENST00000375150 PTCH1Q13635 1447 aa26.27■■□□□ 1.8
PRRT1-202ENST00000375150 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.27■■□□□ 1.8
PRRT1-202ENST00000375150 STRCQ7RTU9 1775 aa26.26■■□□□ 1.8
PRRT1-202ENST00000375150 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PRRT1-202ENST00000375150 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
PRRT1-202ENST00000375150 ROBO2Q9HCK4 1378 aa26.25■■□□□ 1.79
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