RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371786.3

C9orf116-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 116, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf116, Length 612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116-201ENST00000371786 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.4■■□□□ 1.66
C9orf116-201ENST00000371786 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.4■■□□□ 1.66
C9orf116-201ENST00000371786 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
C9orf116-201ENST00000371786 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
C9orf116-201ENST00000371786 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.36■■□□□ 1.65
C9orf116-201ENST00000371786 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.35■■□□□ 1.65
C9orf116-201ENST00000371786 ZFYVE9O95405 1425 aa25.35■■□□□ 1.65
C9orf116-201ENST00000371786 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.34■■□□□ 1.65
C9orf116-201ENST00000371786 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.33■■□□□ 1.65
C9orf116-201ENST00000371786 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.33■■□□□ 1.65
C9orf116-201ENST00000371786 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
C9orf116-201ENST00000371786 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
C9orf116-201ENST00000371786 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.31■■□□□ 1.64
C9orf116-201ENST00000371786 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
C9orf116-201ENST00000371786 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
C9orf116-201ENST00000371786 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
C9orf116-201ENST00000371786 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
C9orf116-201ENST00000371786 PIK3C2GO75747 1445 aa25.28■■□□□ 1.64
C9orf116-201ENST00000371786 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.27■■□□□ 1.64
C9orf116-201ENST00000371786 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.26■■□□□ 1.63
C9orf116-201ENST00000371786 SLIT1O75093 1534 aa25.26■■□□□ 1.63
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C9orf116-201ENST00000371786 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.25■■□□□ 1.63
C9orf116-201ENST00000371786 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.24■■□□□ 1.63
C9orf116-201ENST00000371786 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.23■■□□□ 1.63
C9orf116-201ENST00000371786 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
C9orf116-201ENST00000371786 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf116-201ENST00000371786 LAMC1P11047 1609 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf116-201ENST00000371786 LTKP29376 864 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf116-201ENST00000371786 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.2■■□□□ 1.62
C9orf116-201ENST00000371786 EID1Q9Y6B2 187 aa25.2■■□□□ 1.62
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C9orf116-201ENST00000371786 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.16■■□□□ 1.62
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C9orf116-201ENST00000371786 ALKQ9UM73 1620 aa25.14■■□□□ 1.61
C9orf116-201ENST00000371786 USP47Q96K76 1375 aa25.14■■□□□ 1.61
C9orf116-201ENST00000371786 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.14■■□□□ 1.61
C9orf116-201ENST00000371786 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
C9orf116-201ENST00000371786 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.12■■□□□ 1.61
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C9orf116-201ENST00000371786 ADGRB1O14514 1584 aa25.12■■□□□ 1.61
C9orf116-201ENST00000371786 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.11■■□□□ 1.61
C9orf116-201ENST00000371786 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf116-201ENST00000371786 IQGAP1P46940 1657 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf116-201ENST00000371786 BCANQ96GW7 911 aa25.08■■□□□ 1.61
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C9orf116-201ENST00000371786 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.07■■□□□ 1.6
C9orf116-201ENST00000371786 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa25.06■■□□□ 1.6
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C9orf116-201ENST00000371786 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.99■■□□□ 1.59
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C9orf116-201ENST00000371786 ABCC11Q96J66 1382 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf116-201ENST00000371786 TESK2Q96S53 571 aa24.94■■□□□ 1.58
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C9orf116-201ENST00000371786 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
C9orf116-201ENST00000371786 PIK3R4Q99570 1358 aa24.9■■□□□ 1.58
C9orf116-201ENST00000371786 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.89■■□□□ 1.58
C9orf116-201ENST00000371786 TECPR2O15040 1411 aa24.89■■□□□ 1.58
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C9orf116-201ENST00000371786 SIRT1Q96EB6 747 aa24.88■■□□□ 1.57
C9orf116-201ENST00000371786 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.87■■□□□ 1.57
C9orf116-201ENST00000371786 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.86■■□□□ 1.57
C9orf116-201ENST00000371786 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.86■■□□□ 1.57
C9orf116-201ENST00000371786 CCDC7Q96M83 1385 aa24.86■■□□□ 1.57
C9orf116-201ENST00000371786 SLC24A1O60721 1099 aa24.86■■□□□ 1.57
C9orf116-201ENST00000371786 PRAM1Q96QH2 718 aa24.86■■□□□ 1.57
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C9orf116-201ENST00000371786 TMF1P82094 1093 aa24.85■■□□□ 1.57
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C9orf116-201ENST00000371786 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.85■■□□□ 1.57
C9orf116-201ENST00000371786 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.84■■□□□ 1.57
C9orf116-201ENST00000371786 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.82■■□□□ 1.56
C9orf116-201ENST00000371786 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
C9orf116-201ENST00000371786 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
C9orf116-201ENST00000371786 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.81■■□□□ 1.56
C9orf116-201ENST00000371786 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.8■■□□□ 1.56
C9orf116-201ENST00000371786 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.8■■□□□ 1.56
C9orf116-201ENST00000371786 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.8■■□□□ 1.56
C9orf116-201ENST00000371786 PTCH1Q13635 1447 aa24.78■■□□□ 1.56
C9orf116-201ENST00000371786 CDCA8Q53HL2 280 aa24.77■■□□□ 1.56
C9orf116-201ENST00000371786 KCNA6P17658 529 aa24.76■■□□□ 1.55
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