RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.29■□□□□ 0.36
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PTPRK-201ENST00000368202 NBPF8Q3BBV2 869 aa17.28■□□□□ 0.36
PTPRK-201ENST00000368202 A2ML1A8K2U0 1454 aa17.28■□□□□ 0.36
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PTPRK-201ENST00000368202 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
PTPRK-201ENST00000368202 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa17.26■□□□□ 0.35
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PTPRK-201ENST00000368202 LAMC1P11047 1609 aa17.24■□□□□ 0.35
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PTPRK-201ENST00000368202 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
PTPRK-201ENST00000368202 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRK-201ENST00000368202 CARD11Q9BXL7 1154 aa17.21■□□□□ 0.35
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PTPRK-201ENST00000368202 TMEM2Q9UHN6 1383 aa17.19■□□□□ 0.34
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PTPRK-201ENST00000368202 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
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PTPRK-201ENST00000368202 SLIT1O75093 1534 aa17.17■□□□□ 0.34
PTPRK-201ENST00000368202 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa17.15■□□□□ 0.34
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PTPRK-201ENST00000368202 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
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PTPRK-201ENST00000368202 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
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PTPRK-201ENST00000368202 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa17.1■□□□□ 0.33
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PTPRK-201ENST00000368202 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa17.08■□□□□ 0.32
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PTPRK-201ENST00000368202 ADGRB1O14514 1584 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM132EQ6IEE7 984 aa17.05■□□□□ 0.32
PTPRK-201ENST00000368202 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRK-201ENST00000368202 TRAK1Q9UPV9 953 aa17.03■□□□□ 0.32
PTPRK-201ENST00000368202 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
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PTPRK-201ENST00000368202 SLC24A1O60721 1099 aa17.01■□□□□ 0.31
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PTPRK-201ENST00000368202 KNDC1Q76NI1 1749 aa17.01■□□□□ 0.31
PTPRK-201ENST00000368202 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
PTPRK-201ENST00000368202 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRK-201ENST00000368202 SLC26A8Q96RN1 970 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRK-201ENST00000368202 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRK-201ENST00000368202 TBX22Q9Y458 520 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRK-201ENST00000368202 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
PTPRK-201ENST00000368202 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.98■□□□□ 0.31
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PTPRK-201ENST00000368202 TMF1P82094 1093 aa16.97■□□□□ 0.31
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PTPRK-201ENST00000368202 MED14O60244 1454 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-201ENST00000368202 DLC1Q96QB1 1528 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-201ENST00000368202 POLR3GLQ9BT43 218 aa16.96■□□□□ 0.31
PTPRK-201ENST00000368202 METP08581 1390 aa16.96■□□□□ 0.31
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PTPRK-201ENST00000368202 CDCA8Q53HL2 280 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-201ENST00000368202 CPS1P31327 1500 aa16.94■□□□□ 0.3
PTPRK-201ENST00000368202 ABCC11Q96J66 1382 aa16.93■□□□□ 0.3
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PTPRK-201ENST00000368202 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
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PTPRK-201ENST00000368202 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa16.91■□□□□ 0.3
PTPRK-201ENST00000368202 TECPR2O15040 1411 aa16.9■□□□□ 0.3
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PTPRK-201ENST00000368202 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa16.9■□□□□ 0.3
PTPRK-201ENST00000368202 KIF7Q2M1P5 1343 aa16.9■□□□□ 0.3
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PTPRK-201ENST00000368202 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
PTPRK-201ENST00000368202 STRCQ7RTU9 1775 aa16.89■□□□□ 0.3
PTPRK-201ENST00000368202 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRK-201ENST00000368202 SIRT1Q96EB6 747 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRK-201ENST00000368202 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRK-201ENST00000368202 EVC2Q86UK5 1308 aa16.88■□□□□ 0.29
PTPRK-201ENST00000368202 PTPRUQ92729 1446 aa16.87■□□□□ 0.29
PTPRK-201ENST00000368202 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
PTPRK-201ENST00000368202 DISP3Q9P2K9 1392 aa16.87■□□□□ 0.29
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