RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359128.9

NLRC3-202, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NLRC3, Length 6,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-202ENST00000359128 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.98■□□□□ 0.15
NLRC3-202ENST00000359128 TRIM29Q14134 588 aa15.98■□□□□ 0.15
NLRC3-202ENST00000359128 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.98■□□□□ 0.15
NLRC3-202ENST00000359128 PDE3BQ13370 1112 aa15.98■□□□□ 0.15
NLRC3-202ENST00000359128 WWC1Q8IX03 1113 aa15.97■□□□□ 0.15
NLRC3-202ENST00000359128 ANKRD45Q5TZF3 282 aa15.97■□□□□ 0.15
NLRC3-202ENST00000359128 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.97■□□□□ 0.15
NLRC3-202ENST00000359128 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NLRC3-202ENST00000359128 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NLRC3-202ENST00000359128 PHF14O94880 888 aa15.96■□□□□ 0.15
NLRC3-202ENST00000359128 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
NLRC3-202ENST00000359128 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.96■□□□□ 0.15
NLRC3-202ENST00000359128 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 RUFY2Q8WXA3 655 aa15.96■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 SMARCA4P51532 1647 aa15.95■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 GAPVD1Q14C86 1478 aa15.95■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 ERICH2A1L162 156 aa15.95■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa15.94■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.94■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 NUTM2GQ5VZR2 741 aa15.94■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 MCTP1Q6DN14 999 aa15.93■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 TRDNQ13061 729 aa15.93■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 NFXL1Q6ZNB6 911 aa15.93■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 MIA2Q96PC5 1412 aa15.93■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.93■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 E9PSI1 815 aa15.93■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.93■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 BCL2L13Q9BXK5 485 aa15.93■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 ROCK1Q13464 1354 aa15.92■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.92■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 ANO2Q9NQ90 1003 aa15.92■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC27Q2M243 656 aa15.91■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 RIPK4P57078 832 aa15.91■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 USP35Q9P2H5 1018 aa15.91■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 FYB1O15117 783 aa15.9■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 TPM1P09493 284 aa15.9■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 ESCO1Q5FWF5 840 aa15.9■□□□□ 0.14
NLRC3-202ENST00000359128 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.89■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 CPLX1O14810 134 aa15.89■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.89■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa15.87■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 STRN4Q9NRL3 753 aa15.87■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 USP47Q96K76 1375 aa15.87■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa15.86■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.85■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 PLIN1O60240 522 aa15.85■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 RNF20Q5VTR2 975 aa15.85■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.85■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 NLRP6P59044 892 aa15.85■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 ABTB2Q8N961 1025 aa15.85■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 NEUROD6Q96NK8 337 aa15.85■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.84■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 HMOX1P09601 288 aa15.84■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 TXNDC2Q86VQ3 553 aa15.84■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 FAM177BA6PVY3 158 aa15.84■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 IKQ13123 557 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa15.83■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
NLRC3-202ENST00000359128 PIP4K2BP78356 416 aa15.83■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 CUX1P39880 1505 aa15.83■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 CABP2Q9NPB3 220 aa15.83■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 DDX19BQ9UMR2 479 aa15.83■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa15.82■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.82■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 BECN2A8MW95 431 aa15.82■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 ERC2O15083 957 aa15.82■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 GNAI1P63096 354 aa15.82■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 WASHC4Q2M389 1173 aa15.82■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 RUNDC1Q96C34 613 aa15.81■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 APAF1O14727 1248 aa15.8■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 REC8O95072 547 aa15.8■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 CCDC70Q6NSX1 233 aa15.8■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 DDX11L8A8MPP1 907 aa15.79■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
NLRC3-202ENST00000359128 BRMS1Q9HCU9 246 aa15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms