RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345896.8

CERS2-202, Transcript of ceramide synthase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CERS2, Length 2,170 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2-202ENST00000345896 RGL3Q3MIN7 710 aa39.55■■■■□ 3.92
CERS2-202ENST00000345896 CLTCL1P53675 1640 aa39.53■■■■□ 3.92
CERS2-202ENST00000345896 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.52■■■■□ 3.92
CERS2-202ENST00000345896 LAMC1P11047 1609 aa39.52■■■■□ 3.92
CERS2-202ENST00000345896 ABCC3O15438 1527 aa39.48■■■■□ 3.91
CERS2-202ENST00000345896 PARD3Q8TEW0 1356 aa39.47■■■■□ 3.91
CERS2-202ENST00000345896 NBPF1Q3BBV0 1214 aa39.47■■■■□ 3.91
CERS2-202ENST00000345896 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa39.44■■■■□ 3.9
CERS2-202ENST00000345896 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP39.43■■■■□ 3.9
CERS2-202ENST00000345896 NLRP13Q86W25 1043 aa39.43■■■■□ 3.9
CERS2-202ENST00000345896 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa39.42■■■■□ 3.9
CERS2-202ENST00000345896 UGGT1Q9NYU2 1555 aa39.4■■■■□ 3.9
CERS2-202ENST00000345896 NPATQ14207 1427 aa39.4■■■■□ 3.9
CERS2-202ENST00000345896 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP39.39■■■■□ 3.9
CERS2-202ENST00000345896 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa39.38■■■■□ 3.89
CERS2-202ENST00000345896 REREQ9P2R6 1566 aa39.37■■■■□ 3.89
CERS2-202ENST00000345896 CCDC136Q96JN2 1154 aa39.36■■■■□ 3.89
CERS2-202ENST00000345896 TESK2Q96S53 571 aa39.36■■■■□ 3.89
CERS2-202ENST00000345896 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
CERS2-202ENST00000345896 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.33■■■■□ 3.89
CERS2-202ENST00000345896 DISP3Q9P2K9 1392 aa39.32■■■■□ 3.88
CERS2-202ENST00000345896 KIF1BO60333 1816 aa39.32■■■■□ 3.88
CERS2-202ENST00000345896 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa39.3■■■■□ 3.88
CERS2-202ENST00000345896 ERICH6Q7L0X2 663 aa39.29■■■■□ 3.88
CERS2-202ENST00000345896 AGLP35573 1532 aa39.28■■■■□ 3.88
CERS2-202ENST00000345896 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.26■■■■□ 3.88
CERS2-202ENST00000345896 PDE3BQ13370 1112 aa39.25■■■■□ 3.87
CERS2-202ENST00000345896 INSRP06213 1382 aa39.24■■■■□ 3.87
CERS2-202ENST00000345896 MROH2AA6NES4 1674 aa39.23■■■■□ 3.87
CERS2-202ENST00000345896 RRP1P56182 461 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
CERS2-202ENST00000345896 TMF1P82094 1093 aa39.21■■■■□ 3.87
CERS2-202ENST00000345896 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa39.2■■■■□ 3.87
CERS2-202ENST00000345896 MADDQ8WXG6 1647 aa39.19■■■■□ 3.86
CERS2-202ENST00000345896 NOS1P29475 1434 aa39.18■■■■□ 3.86
CERS2-202ENST00000345896 PANK3Q9H999 370 aa39.18■■■■□ 3.86
CERS2-202ENST00000345896 RCAN3Q9UKA8 241 aa39.16■■■■□ 3.86
CERS2-202ENST00000345896 SYNMO15061 1565 aa39.16■■■■□ 3.86
CERS2-202ENST00000345896 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.15■■■■□ 3.86
CERS2-202ENST00000345896 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
CERS2-202ENST00000345896 ADGRB3O60242 1522 aa39.13■■■■□ 3.85
CERS2-202ENST00000345896 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP39.13■■■■□ 3.85
CERS2-202ENST00000345896 IFT172Q9UG01 1749 aa39.13■■■■□ 3.85
CERS2-202ENST00000345896 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.12■■■■□ 3.85
CERS2-202ENST00000345896 PIK3C2BO00750 1634 aa39.1■■■■□ 3.85
CERS2-202ENST00000345896 PREX1Q8TCU6 1659 aa39.09■■■■□ 3.85
CERS2-202ENST00000345896 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP39.08■■■■□ 3.85
CERS2-202ENST00000345896 STAC3Q96MF2 364 aa39.08■■■■□ 3.85
CERS2-202ENST00000345896 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP39.08■■■■□ 3.85
CERS2-202ENST00000345896 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
CERS2-202ENST00000345896 MLECQ14165 292 aa39.06■■■■□ 3.84
CERS2-202ENST00000345896 PPP6R1Q9UPN7 881 aa39.04■■■■□ 3.84
CERS2-202ENST00000345896 EXOC6Q8TAG9 804 aa39.02■■■■□ 3.84
CERS2-202ENST00000345896 MYOM2P54296 1465 aa39.02■■■■□ 3.84
CERS2-202ENST00000345896 IQGAP1P46940 1657 aa39.02■■■■□ 3.84
CERS2-202ENST00000345896 PPLO60437 1756 aa38.98■■■■□ 3.83
CERS2-202ENST00000345896 CDCA7LQ96GN5 454 aa38.98■■■■□ 3.83
CERS2-202ENST00000345896 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa38.96■■■■□ 3.83
CERS2-202ENST00000345896 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
CERS2-202ENST00000345896 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP38.95■■■■□ 3.83
CERS2-202ENST00000345896 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa38.95■■■■□ 3.83
CERS2-202ENST00000345896 IDI1Q13907 227 aa38.93■■■■□ 3.82
CERS2-202ENST00000345896 ERVK-7P63135 1459 aa38.93■■■■□ 3.82
CERS2-202ENST00000345896 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP38.92■■■■□ 3.82
CERS2-202ENST00000345896 NRXN1Q9ULB1 1477 aa38.91■■■■□ 3.82
CERS2-202ENST00000345896 SLC52A1Q9NWF4 448 aa38.9■■■■□ 3.82
CERS2-202ENST00000345896 MYO5BQ9ULV0 1848 aa38.89■■■■□ 3.82
CERS2-202ENST00000345896 CDCA8Q53HL2 280 aa38.89■■■■□ 3.82
CERS2-202ENST00000345896 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP38.88■■■■□ 3.81
CERS2-202ENST00000345896 KNSTRNQ9Y448 316 aa38.88■■■■□ 3.81
CERS2-202ENST00000345896 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa38.84■■■■□ 3.81
CERS2-202ENST00000345896 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa38.83■■■■□ 3.81
CERS2-202ENST00000345896 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
CERS2-202ENST00000345896 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP38.83■■■■□ 3.81
CERS2-202ENST00000345896 CFAP70Q5T0N1 1121 aa38.83■■■■□ 3.81
CERS2-202ENST00000345896 PPP2R1AP30153 589 aa38.82■■■■□ 3.8
CERS2-202ENST00000345896 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.8
CERS2-202ENST00000345896 ADAMTS8Q9UP79 889 aa38.82■■■■□ 3.8
CERS2-202ENST00000345896 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa38.82■■■■□ 3.8
CERS2-202ENST00000345896 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa38.81■■■■□ 3.8
CERS2-202ENST00000345896 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP38.79■■■■□ 3.8
CERS2-202ENST00000345896 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
CERS2-202ENST00000345896 PIK3C2GO75747 1445 aa38.77■■■■□ 3.8
CERS2-202ENST00000345896 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa38.76■■■■□ 3.8
CERS2-202ENST00000345896 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP38.76■■■■□ 3.8
CERS2-202ENST00000345896 ZMYM3Q14202 1370 aa38.76■■■■□ 3.79
CERS2-202ENST00000345896 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa38.74■■■■□ 3.79
CERS2-202ENST00000345896 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP38.73■■■■□ 3.79
CERS2-202ENST00000345896 PLIN1O60240 522 aa38.72■■■■□ 3.79
CERS2-202ENST00000345896 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP38.72■■■■□ 3.79
CERS2-202ENST00000345896 MYOM1P52179 1685 aa38.71■■■■□ 3.79
CERS2-202ENST00000345896 MS4A1P11836 297 aa38.7■■■■□ 3.79
CERS2-202ENST00000345896 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa38.67■■■■□ 3.78
CERS2-202ENST00000345896 VGFO15240 615 aaPredicted RBP38.67■■■■□ 3.78
CERS2-202ENST00000345896 CRBNQ96SW2 442 aa38.67■■■■□ 3.78
CERS2-202ENST00000345896 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa38.66■■■■□ 3.78
CERS2-202ENST00000345896 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
CERS2-202ENST00000345896 ZNF521Q96K83 1311 aa38.65■■■■□ 3.78
CERS2-202ENST00000345896 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP38.64■■■■□ 3.78
CERS2-202ENST00000345896 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.78
CERS2-202ENST00000345896 BCL11AQ9H165 835 aa38.63■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms