RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 USP47Q96K76 1375 aa27.5■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 ANO2Q9NQ90 1003 aa27.49■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 PTPRGP23470 1445 aa27.49■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 RRP1P56182 461 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 RIPK4P57078 832 aa27.48■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 AMOTL1Q8IY63 956 aa27.48■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 VPS37DQ86XT2 251 aa27.48■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 DDX11L8A8MPP1 907 aa27.47■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 FAM161AQ3B820 660 aa27.47■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa27.47■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
PTPRM-201ENST00000332175 PDE4AP27815 886 aa27.45■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa27.45■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 KLHL34Q8N239 644 aa27.43■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 NUTM2GQ5VZR2 741 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 BECN2A8MW95 431 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 TRIM29Q14134 588 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 HMOX1P09601 288 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 FOSBP53539 338 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 TPM2P07951 284 aa27.41■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 RUFY2Q8WXA3 655 aa27.4■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
PTPRM-201ENST00000332175 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa27.38■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 DDX58O95786 925 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 NFXL1Q6ZNB6 911 aa27.37■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 TSPYL4Q9UJ04 414 aa27.37■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.36■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 CPLX1O14810 134 aa27.36■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.35■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.34■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 CHMP4CQ96CF2 233 aa27.33■■□□□ 1.97
PTPRM-201ENST00000332175 TPM1P09493 284 aa27.33■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.33■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 FYB1O15117 783 aa27.32■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF592Q92610 1267 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 REC8O95072 547 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 TRDNQ13061 729 aa27.31■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 OSCARQ8IYS5 282 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 CABP2Q9NPB3 220 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 ATF3P18847 181 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 NEUROD6Q96NK8 337 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 RUNDC1Q96C34 613 aa27.28■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 BICD2Q8TD16 824 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 ERICH2A1L162 156 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 NLRP2Q9NX02 1062 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO3Q9UK99 471 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.27■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 PRDM2Q13029 1718 aa27.27■■□□□ 1.96
PTPRM-201ENST00000332175 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 KDM4AO75164 1064 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 ROCK1Q13464 1354 aa27.25■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC27Q2M243 656 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 RNF20Q5VTR2 975 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 MTMR7Q9Y216 660 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 LNPKQ9C0E8 428 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 USP35Q9P2H5 1018 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 WASHC4Q2M389 1173 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 FAM177BA6PVY3 158 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 GNAI1P63096 354 aa27.2■■□□□ 1.95
PTPRM-201ENST00000332175 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
PTPRM-201ENST00000332175 SMC3Q9UQE7 1217 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRM-201ENST00000332175 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
PTPRM-201ENST00000332175 PANK1Q8TE04 598 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC70Q6NSX1 233 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRM-201ENST00000332175 GSE1Q14687 1217 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRM-201ENST00000332175 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRM-201ENST00000332175 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
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