RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 ATP10AO60312 1499 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 UNC13BO14795 1591 aa14.63□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 ABCA8O94911 1581 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 TMF1P82094 1093 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 GOLGA2Q08379 1002 aa14.62□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 PIK3C2GO75747 1445 aa14.61□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 SLFN5Q08AF3 891 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 USP19O94966 1318 aa14.6□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 ZMYM3Q14202 1370 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 ABCC2Q92887 1545 aa14.59□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 PPP2R1AP30153 589 aa14.58□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.58□□□□□ -0.07
GINS3-202ENST00000328514 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.58□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 NINLQ9Y2I6 1382 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 MYO5CQ9NQX4 1742 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 NGEFQ8N5V2 710 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 SYNMO15061 1565 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.57□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 ATP10BO94823 1461 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 ADGRL1O94910 1474 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.56□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 NLRP1Q9C000 1473 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 PLXNC1O60486 1568 aa14.55□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 FAM69CQ0P6D2 419 aa14.54□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 BECN1Q14457 450 aa14.54□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 PDE3AQ14432 1141 aa14.54□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 CGNL1Q0VF96 1302 aa14.54□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.54□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 RGS3P49796 1198 aa14.53□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.53□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 IQGAP1P46940 1657 aa14.53□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 AAMPQ13685 434 aa14.53□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.53□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.53□□□□□ -0.08
GINS3-202ENST00000328514 PREX2Q70Z35 1606 aa14.52□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 E9PSI1 815 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 SOCS7O14512 581 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 CDCA8Q53HL2 280 aa14.51□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
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GINS3-202ENST00000328514 POGKQ9P215 609 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.5□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 IGHDP01880 384 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 STAC3Q96MF2 364 aa14.49□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 MADDQ8WXG6 1647 aa14.48□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 DIP2BQ9P265 1576 aa14.47□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 ILDR2Q71H61 639 aa14.47□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 CLUAP1Q96AJ1 413 aa14.47□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 JPH4Q96JJ6 628 aa14.47□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 MYOM1P52179 1685 aa14.46□□□□□ -0.09
GINS3-202ENST00000328514 FSD2A1L4K1 749 aa14.45□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 BCAR3O75815 825 aa14.45□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.45□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 SEC24BO95487 1268 aa14.45□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 TBC1D32Q96NH3 1257 aa14.45□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 TSPOAP1O95153 1857 aa14.44□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 APAF1O14727 1248 aa14.43□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.42□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.42□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.41□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.41□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 CLCN1P35523 988 aa14.41□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.4□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.4□□□□□ -0.1
GINS3-202ENST00000328514 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.39□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 CCDC146Q8IYE0 955 aa14.39□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 TRPM2O94759 1503 aa14.38□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.38□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.38□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 MCM4P33991 863 aa14.37□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 WWC1Q8IX03 1113 aa14.37□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.37□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 COG6Q9Y2V7 657 aa14.36□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 KANK1Q14678 1352 aa14.36□□□□□ -0.11
GINS3-202ENST00000328514 PTPRTO14522 1441 aa14.36□□□□□ -0.11
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