RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328020.10

CMTM1-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM1, Length 981 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-201ENST00000328020 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.39■□□□□ 0.85
CMTM1-201ENST00000328020 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.39■□□□□ 0.85
CMTM1-201ENST00000328020 RIMS2Q9UQ26 1411 aa20.39■□□□□ 0.85
CMTM1-201ENST00000328020 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.39■□□□□ 0.85
CMTM1-201ENST00000328020 NEUROD1Q13562 356 aa20.38■□□□□ 0.85
CMTM1-201ENST00000328020 VGFO15240 615 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CMTM1-201ENST00000328020 STAC3Q96MF2 364 aa20.37■□□□□ 0.85
CMTM1-201ENST00000328020 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CMTM1-201ENST00000328020 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.36■□□□□ 0.85
CMTM1-201ENST00000328020 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CMTM1-201ENST00000328020 ZFYVE9O95405 1425 aa20.35■□□□□ 0.85
CMTM1-201ENST00000328020 BCANQ96GW7 911 aa20.34■□□□□ 0.85
CMTM1-201ENST00000328020 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.33■□□□□ 0.85
CMTM1-201ENST00000328020 LTKP29376 864 aa20.32■□□□□ 0.84
CMTM1-201ENST00000328020 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa20.32■□□□□ 0.84
CMTM1-201ENST00000328020 TONSLQ96HA7 1378 aa20.31■□□□□ 0.84
CMTM1-201ENST00000328020 MED14O60244 1454 aa20.3■□□□□ 0.84
CMTM1-201ENST00000328020 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CMTM1-201ENST00000328020 PPLO60437 1756 aa20.3■□□□□ 0.84
CMTM1-201ENST00000328020 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa20.3■□□□□ 0.84
CMTM1-201ENST00000328020 STRCQ7RTU9 1775 aa20.29■□□□□ 0.84
CMTM1-201ENST00000328020 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CMTM1-201ENST00000328020 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.29■□□□□ 0.84
CMTM1-201ENST00000328020 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.29■□□□□ 0.84
CMTM1-201ENST00000328020 IQGAP1P46940 1657 aa20.26■□□□□ 0.83
CMTM1-201ENST00000328020 IFT172Q9UG01 1749 aa20.26■□□□□ 0.83
CMTM1-201ENST00000328020 MYOM2P54296 1465 aa20.25■□□□□ 0.83
CMTM1-201ENST00000328020 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.25■□□□□ 0.83
CMTM1-201ENST00000328020 L3MBTL2Q969R5 705 aa20.24■□□□□ 0.83
CMTM1-201ENST00000328020 TBX22Q9Y458 520 aa20.21■□□□□ 0.83
CMTM1-201ENST00000328020 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.21■□□□□ 0.83
CMTM1-201ENST00000328020 DIP2AQ14689 1571 aa20.21■□□□□ 0.83
CMTM1-201ENST00000328020 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa20.21■□□□□ 0.83
CMTM1-201ENST00000328020 SLC26A8Q96RN1 970 aa20.19■□□□□ 0.82
CMTM1-201ENST00000328020 NRXN1Q9ULB1 1477 aa20.18■□□□□ 0.82
CMTM1-201ENST00000328020 PIK3C2GO75747 1445 aa20.18■□□□□ 0.82
CMTM1-201ENST00000328020 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
CMTM1-201ENST00000328020 PIK3R4Q99570 1358 aa20.16■□□□□ 0.82
CMTM1-201ENST00000328020 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa20.15■□□□□ 0.82
CMTM1-201ENST00000328020 LAMC1P11047 1609 aa20.15■□□□□ 0.82
CMTM1-201ENST00000328020 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
CMTM1-201ENST00000328020 ALKQ9UM73 1620 aa20.13■□□□□ 0.81
CMTM1-201ENST00000328020 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.13■□□□□ 0.81
CMTM1-201ENST00000328020 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.13■□□□□ 0.81
CMTM1-201ENST00000328020 KCNA6P17658 529 aa20.1■□□□□ 0.81
CMTM1-201ENST00000328020 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.1■□□□□ 0.81
CMTM1-201ENST00000328020 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa20.09■□□□□ 0.81
CMTM1-201ENST00000328020 METP08581 1390 aa20.08■□□□□ 0.8
CMTM1-201ENST00000328020 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
CMTM1-201ENST00000328020 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
CMTM1-201ENST00000328020 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
CMTM1-201ENST00000328020 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa20.05■□□□□ 0.8
CMTM1-201ENST00000328020 CPS1P31327 1500 aa20.03■□□□□ 0.8
CMTM1-201ENST00000328020 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.03■□□□□ 0.8
CMTM1-201ENST00000328020 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CMTM1-201ENST00000328020 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
CMTM1-201ENST00000328020 NBPF8Q3BBV2 869 aa20.02■□□□□ 0.8
CMTM1-201ENST00000328020 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
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CMTM1-201ENST00000328020 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 STK26Q9P289 416 aa20.01■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.01■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 ABCC11Q96J66 1382 aa20■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 RALGAPBQ86X10 1494 aa19.99■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 PTPRUQ92729 1446 aa19.99■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 ADGRB1O14514 1584 aa19.99■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.98■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 SIRT1Q96EB6 747 aa19.98■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 TECPR2O15040 1411 aa19.97■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 PTCH1Q13635 1447 aa19.97■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 CARD11Q9BXL7 1154 aa19.97■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.97■□□□□ 0.79
CMTM1-201ENST00000328020 KNDC1Q76NI1 1749 aa19.96■□□□□ 0.79
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CMTM1-201ENST00000328020 LTBP4Q8N2S1 1624 aa19.95■□□□□ 0.78
CMTM1-201ENST00000328020 C14orf37Q86TY3 774 aa19.95■□□□□ 0.78
CMTM1-201ENST00000328020 POGKQ9P215 609 aa19.95■□□□□ 0.78
CMTM1-201ENST00000328020 TRAK1Q9UPV9 953 aa19.95■□□□□ 0.78
CMTM1-201ENST00000328020 STRCP1A6NGW2 1772 aa19.95■□□□□ 0.78
CMTM1-201ENST00000328020 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
CMTM1-201ENST00000328020 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa19.94■□□□□ 0.78
CMTM1-201ENST00000328020 DLC1Q96QB1 1528 aa19.94■□□□□ 0.78
CMTM1-201ENST00000328020 FAM135BQ49AJ0 1406 aa19.93■□□□□ 0.78
CMTM1-201ENST00000328020 TMEM94Q12767 1356 aa19.92■□□□□ 0.78
CMTM1-201ENST00000328020 ROBO2Q9HCK4 1378 aa19.92■□□□□ 0.78
CMTM1-201ENST00000328020 LRRC7Q96NW7 1537 aa19.92■□□□□ 0.78
CMTM1-201ENST00000328020 PRAM1Q96QH2 718 aa19.9■□□□□ 0.78
CMTM1-201ENST00000328020 IQSEC2Q5JU85 1478 aa19.89■□□□□ 0.77
CMTM1-201ENST00000328020 CERKQ8TCT0 537 aa19.89■□□□□ 0.77
CMTM1-201ENST00000328020 MSH6P52701 1360 aa19.88■□□□□ 0.77
CMTM1-201ENST00000328020 SLC24A1O60721 1099 aa19.87■□□□□ 0.77
CMTM1-201ENST00000328020 WAPLQ7Z5K2 1190 aa19.87■□□□□ 0.77
CMTM1-201ENST00000328020 C19orf44Q9H6X5 657 aa19.87■□□□□ 0.77
CMTM1-201ENST00000328020 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
CMTM1-201ENST00000328020 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
CMTM1-201ENST00000328020 ATF3P18847 181 aa19.84■□□□□ 0.77
CMTM1-201ENST00000328020 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP19.84■□□□□ 0.77
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