RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316436.3

LSMEM2-201, Transcript of leucine rich single-pass membrane protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LSMEM2, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSMEM2-201ENST00000316436 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.87■■□□□ 1.25
LSMEM2-201ENST00000316436 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.86■■□□□ 1.25
LSMEM2-201ENST00000316436 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.86■■□□□ 1.25
LSMEM2-201ENST00000316436 SLIT1O75093 1534 aa22.84■■□□□ 1.25
LSMEM2-201ENST00000316436 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.84■■□□□ 1.25
LSMEM2-201ENST00000316436 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.84■■□□□ 1.25
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
LSMEM2-201ENST00000316436 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.82■■□□□ 1.24
LSMEM2-201ENST00000316436 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.81■■□□□ 1.24
LSMEM2-201ENST00000316436 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.81■■□□□ 1.24
LSMEM2-201ENST00000316436 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.8■■□□□ 1.24
LSMEM2-201ENST00000316436 PIK3C2GO75747 1445 aa22.8■■□□□ 1.24
LSMEM2-201ENST00000316436 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.8■■□□□ 1.24
LSMEM2-201ENST00000316436 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.8■■□□□ 1.24
LSMEM2-201ENST00000316436 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.79■■□□□ 1.24
LSMEM2-201ENST00000316436 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.79■■□□□ 1.24
LSMEM2-201ENST00000316436 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.78■■□□□ 1.24
LSMEM2-201ENST00000316436 IQGAP1P46940 1657 aa22.77■■□□□ 1.24
LSMEM2-201ENST00000316436 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
LSMEM2-201ENST00000316436 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
LSMEM2-201ENST00000316436 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.75■■□□□ 1.23
LSMEM2-201ENST00000316436 LAMC1P11047 1609 aa22.74■■□□□ 1.23
LSMEM2-201ENST00000316436 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.73■■□□□ 1.23
LSMEM2-201ENST00000316436 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
LSMEM2-201ENST00000316436 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.72■■□□□ 1.23
LSMEM2-201ENST00000316436 STAC3Q96MF2 364 aa22.72■■□□□ 1.23
LSMEM2-201ENST00000316436 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
LSMEM2-201ENST00000316436 LTKP29376 864 aa22.7■■□□□ 1.22
LSMEM2-201ENST00000316436 ADGRB1O14514 1584 aa22.69■■□□□ 1.22
LSMEM2-201ENST00000316436 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
LSMEM2-201ENST00000316436 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
LSMEM2-201ENST00000316436 ALKQ9UM73 1620 aa22.68■■□□□ 1.22
LSMEM2-201ENST00000316436 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.68■■□□□ 1.22
LSMEM2-201ENST00000316436 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.66■■□□□ 1.22
LSMEM2-201ENST00000316436 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.65■■□□□ 1.22
LSMEM2-201ENST00000316436 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.65■■□□□ 1.22
LSMEM2-201ENST00000316436 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.64■■□□□ 1.21
LSMEM2-201ENST00000316436 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa22.64■■□□□ 1.21
LSMEM2-201ENST00000316436 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
LSMEM2-201ENST00000316436 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
LSMEM2-201ENST00000316436 MED14O60244 1454 aa22.63■■□□□ 1.21
LSMEM2-201ENST00000316436 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.62■■□□□ 1.21
LSMEM2-201ENST00000316436 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
LSMEM2-201ENST00000316436 DIP2AQ14689 1571 aa22.6■■□□□ 1.21
LSMEM2-201ENST00000316436 STRCQ7RTU9 1775 aa22.6■■□□□ 1.21
LSMEM2-201ENST00000316436 HSPA2P54652 639 aa22.58■■□□□ 1.2
LSMEM2-201ENST00000316436 EID1Q9Y6B2 187 aa22.58■■□□□ 1.2
LSMEM2-201ENST00000316436 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
LSMEM2-201ENST00000316436 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
LSMEM2-201ENST00000316436 USP47Q96K76 1375 aa22.55■■□□□ 1.2
LSMEM2-201ENST00000316436 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
LSMEM2-201ENST00000316436 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.54■■□□□ 1.2
LSMEM2-201ENST00000316436 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.54■■□□□ 1.2
LSMEM2-201ENST00000316436 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.54■■□□□ 1.2
LSMEM2-201ENST00000316436 METP08581 1390 aa22.54■■□□□ 1.2
LSMEM2-201ENST00000316436 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.52■■□□□ 1.2
LSMEM2-201ENST00000316436 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.52■■□□□ 1.2
LSMEM2-201ENST00000316436 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
LSMEM2-201ENST00000316436 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
LSMEM2-201ENST00000316436 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
LSMEM2-201ENST00000316436 PTPRUQ92729 1446 aa22.49■■□□□ 1.19
LSMEM2-201ENST00000316436 CPS1P31327 1500 aa22.48■■□□□ 1.19
LSMEM2-201ENST00000316436 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.48■■□□□ 1.19
LSMEM2-201ENST00000316436 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
LSMEM2-201ENST00000316436 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
LSMEM2-201ENST00000316436 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.46■■□□□ 1.19
LSMEM2-201ENST00000316436 DLC1Q96QB1 1528 aa22.46■■□□□ 1.19
LSMEM2-201ENST00000316436 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
LSMEM2-201ENST00000316436 TECPR2O15040 1411 aa22.45■■□□□ 1.18
LSMEM2-201ENST00000316436 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
LSMEM2-201ENST00000316436 BCANQ96GW7 911 aa22.45■■□□□ 1.18
LSMEM2-201ENST00000316436 NWD1Q149M9 1564 aa22.44■■□□□ 1.18
LSMEM2-201ENST00000316436 TBX22Q9Y458 520 aa22.44■■□□□ 1.18
LSMEM2-201ENST00000316436 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.41■■□□□ 1.18
LSMEM2-201ENST00000316436 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.41■■□□□ 1.18
LSMEM2-201ENST00000316436 ABCC11Q96J66 1382 aa22.4■■□□□ 1.18
LSMEM2-201ENST00000316436 PIK3R4Q99570 1358 aa22.4■■□□□ 1.18
LSMEM2-201ENST00000316436 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.4■■□□□ 1.18
LSMEM2-201ENST00000316436 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
LSMEM2-201ENST00000316436 STK26Q9P289 416 aa22.39■■□□□ 1.17
LSMEM2-201ENST00000316436 PTCH1Q13635 1447 aa22.37■■□□□ 1.17
LSMEM2-201ENST00000316436 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.37■■□□□ 1.17
LSMEM2-201ENST00000316436 TESK2Q96S53 571 aa22.37■■□□□ 1.17
LSMEM2-201ENST00000316436 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.36■■□□□ 1.17
LSMEM2-201ENST00000316436 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
LSMEM2-201ENST00000316436 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.34■■□□□ 1.17
LSMEM2-201ENST00000316436 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.34■■□□□ 1.17
LSMEM2-201ENST00000316436 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.34■■□□□ 1.17
LSMEM2-201ENST00000316436 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
LSMEM2-201ENST00000316436 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
LSMEM2-201ENST00000316436 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.32■■□□□ 1.16
LSMEM2-201ENST00000316436 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
LSMEM2-201ENST00000316436 PRAM1Q96QH2 718 aa22.31■■□□□ 1.16
LSMEM2-201ENST00000316436 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa22.31■■□□□ 1.16
LSMEM2-201ENST00000316436 ADGRB2O60241 1585 aa22.3■■□□□ 1.16
LSMEM2-201ENST00000316436 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
LSMEM2-201ENST00000316436 KCNA6P17658 529 aa22.29■■□□□ 1.16
LSMEM2-201ENST00000316436 NALCNQ8IZF0 1738 aa22.29■■□□□ 1.16
LSMEM2-201ENST00000316436 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.28■■□□□ 1.16
LSMEM2-201ENST00000316436 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
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