RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297991.4

AQP3-201, Transcript of aquaporin 3 (Gill blood group), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AQP3, Length 1,849 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP3-201ENST00000297991 TNRQ92752 1358 aa22.26■■□□□ 1.15
AQP3-201ENST00000297991 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
AQP3-201ENST00000297991 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.24■■□□□ 1.15
AQP3-201ENST00000297991 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
AQP3-201ENST00000297991 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
AQP3-201ENST00000297991 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.22■■□□□ 1.15
AQP3-201ENST00000297991 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.21■■□□□ 1.15
AQP3-201ENST00000297991 STAC3Q96MF2 364 aa22.21■■□□□ 1.15
AQP3-201ENST00000297991 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.2■■□□□ 1.14
AQP3-201ENST00000297991 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.2■■□□□ 1.14
AQP3-201ENST00000297991 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.2■■□□□ 1.14
AQP3-201ENST00000297991 NLRP1Q9C000 1473 aa22.18■■□□□ 1.14
AQP3-201ENST00000297991 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.18■■□□□ 1.14
AQP3-201ENST00000297991 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.17■■□□□ 1.14
AQP3-201ENST00000297991 MYOM2P54296 1465 aa22.16■■□□□ 1.14
AQP3-201ENST00000297991 IFT172Q9UG01 1749 aa22.16■■□□□ 1.14
AQP3-201ENST00000297991 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.14■■□□□ 1.13
AQP3-201ENST00000297991 PTPRMP28827 1452 aa22.13■■□□□ 1.13
AQP3-201ENST00000297991 PPLO60437 1756 aa22.13■■□□□ 1.13
AQP3-201ENST00000297991 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.13■■□□□ 1.13
AQP3-201ENST00000297991 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
AQP3-201ENST00000297991 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.13■■□□□ 1.13
AQP3-201ENST00000297991 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.12■■□□□ 1.13
AQP3-201ENST00000297991 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.11■■□□□ 1.13
AQP3-201ENST00000297991 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.1■■□□□ 1.13
AQP3-201ENST00000297991 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.1■■□□□ 1.13
AQP3-201ENST00000297991 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.09■■□□□ 1.13
AQP3-201ENST00000297991 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.09■■□□□ 1.13
AQP3-201ENST00000297991 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.09■■□□□ 1.13
AQP3-201ENST00000297991 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
AQP3-201ENST00000297991 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.08■■□□□ 1.12
AQP3-201ENST00000297991 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.08■■□□□ 1.12
AQP3-201ENST00000297991 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
AQP3-201ENST00000297991 ZFYVE9O95405 1425 aa22.06■■□□□ 1.12
AQP3-201ENST00000297991 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
AQP3-201ENST00000297991 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.05■■□□□ 1.12
AQP3-201ENST00000297991 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.122e-8■■■■□ 23.8
AQP3-201ENST00000297991 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
AQP3-201ENST00000297991 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.04■■□□□ 1.12
AQP3-201ENST00000297991 PIK3C2GO75747 1445 aa22.04■■□□□ 1.12
AQP3-201ENST00000297991 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
AQP3-201ENST00000297991 MSH5O43196 834 aa22.03■■□□□ 1.12
AQP3-201ENST00000297991 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
AQP3-201ENST00000297991 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.03■■□□□ 1.12
AQP3-201ENST00000297991 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.02■■□□□ 1.12
AQP3-201ENST00000297991 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.01■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.01■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.99■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 LAMC1P11047 1609 aa21.98■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 SLIT1O75093 1534 aa21.97■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 CFAP70Q5T0N1 1121 aa21.97■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 CCDC7Q96M83 1385 aa21.97■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 USP47Q96K76 1375 aa21.96■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.96■■□□□ 1.11
AQP3-201ENST00000297991 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
AQP3-201ENST00000297991 EID1Q9Y6B2 187 aa21.94■■□□□ 1.1
AQP3-201ENST00000297991 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa21.93■■□□□ 1.1
AQP3-201ENST00000297991 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.91■■□□□ 1.1
AQP3-201ENST00000297991 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.9■■□□□ 1.1
AQP3-201ENST00000297991 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
AQP3-201ENST00000297991 LTKP29376 864 aa21.9■■□□□ 1.1
AQP3-201ENST00000297991 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
AQP3-201ENST00000297991 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
AQP3-201ENST00000297991 ADGRB1O14514 1584 aa21.89■■□□□ 1.09
AQP3-201ENST00000297991 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa21.88■■□□□ 1.09
AQP3-201ENST00000297991 ALKQ9UM73 1620 aa21.88■■□□□ 1.09
AQP3-201ENST00000297991 IQGAP1P46940 1657 aa21.87■■□□□ 1.09
AQP3-201ENST00000297991 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa21.86■■□□□ 1.09
AQP3-201ENST00000297991 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
AQP3-201ENST00000297991 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.84■■□□□ 1.09
AQP3-201ENST00000297991 TMEM132EQ6IEE7 984 aa21.84■■□□□ 1.09
AQP3-201ENST00000297991 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa21.83■■□□□ 1.09
AQP3-201ENST00000297991 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.83■■□□□ 1.09
AQP3-201ENST00000297991 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
AQP3-201ENST00000297991 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.82■■□□□ 1.08
AQP3-201ENST00000297991 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
AQP3-201ENST00000297991 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.8■■□□□ 1.08
AQP3-201ENST00000297991 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.79■■□□□ 1.08
AQP3-201ENST00000297991 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
AQP3-201ENST00000297991 DIP2AQ14689 1571 aa21.77■■□□□ 1.08
AQP3-201ENST00000297991 METP08581 1390 aa21.77■■□□□ 1.08
AQP3-201ENST00000297991 MED14O60244 1454 aa21.76■■□□□ 1.07
AQP3-201ENST00000297991 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.75■■□□□ 1.07
AQP3-201ENST00000297991 SLC26A8Q96RN1 970 aa21.75■■□□□ 1.07
AQP3-201ENST00000297991 STK26Q9P289 416 aa21.75■■□□□ 1.07
AQP3-201ENST00000297991 CCDC184Q52MB2 194 aa21.74■■□□□ 1.07
AQP3-201ENST00000297991 TBX22Q9Y458 520 aa21.74■■□□□ 1.07
AQP3-201ENST00000297991 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
AQP3-201ENST00000297991 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
AQP3-201ENST00000297991 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
AQP3-201ENST00000297991 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
AQP3-201ENST00000297991 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
AQP3-201ENST00000297991 TESK2Q96S53 571 aa21.73■■□□□ 1.07
AQP3-201ENST00000297991 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms