RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 RXRBP28702 533 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC52A1Q9NWF4 448 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF15Q9NS87 1388 aa12.41□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 MROH1Q8NDA8 1641 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM52Q96A61 297 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP3K1Q13233 1512 aa12.4□□□□□ -0.42
PGGT1B-201ENST00000296642 CADPS2Q86UW7 1296 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-201ENST00000296642 NWD1Q149M9 1564 aa12.39□□□□□ -0.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ATF3P18847 181 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1B-201ENST00000296642 IDI1Q13907 227 aa12.38□□□□□ -0.43
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.37□□□□□ -0.43
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
PGGT1B-201ENST00000296642 TET3O43151 1660 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-201ENST00000296642 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa12.36□□□□□ -0.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRB3O60242 1522 aa12.35□□□□□ -0.43
PGGT1B-201ENST00000296642 LMTK2Q8IWU2 1503 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf44Q9H6X5 657 aa12.34□□□□□ -0.43
PGGT1B-201ENST00000296642 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 APLP2Q06481 763 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 TBX22Q9Y458 520 aa12.33□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 SHPRHQ149N8 1683 aa12.32□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 PIK3R4Q99570 1358 aa12.31□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 NGLY1Q96IV0 654 aa12.31□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 NOS1P29475 1434 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.3□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 LRP6O75581 1613 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 AFF2P51816 1311 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 CROCC2H7BZ55 1655 aa12.29□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 RIMS2Q9UQ26 1411 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 DIP2AQ14689 1571 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCC5O15440 1437 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 DAPK1P53355 1430 aa12.28□□□□□ -0.44
PGGT1B-201ENST00000296642 CHGAP10645 457 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-201ENST00000296642 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.27□□□□□ -0.45
PGGT1B-201ENST00000296642 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-201ENST00000296642 ZRANB1Q9UGI0 708 aa12.26□□□□□ -0.45
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PGGT1B-201ENST00000296642 DCCP43146 1447 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.26□□□□□ -0.45
PGGT1B-201ENST00000296642 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
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PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf37Q96NL8 207 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-201ENST00000296642 CHIC2Q9UKJ5 165 aa12.24□□□□□ -0.45
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPM2O94759 1503 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-201ENST00000296642 SETD5Q9C0A6 1442 aa12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-201ENST00000296642 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC125Q86Z20 511 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-201ENST00000296642 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa12.22□□□□□ -0.45
PGGT1B-201ENST00000296642 POTEHQ6S545 545 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-201ENST00000296642 GCC2Q8IWJ2 1684 aa12.21□□□□□ -0.45
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-201ENST00000296642 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS12O14924 1447 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa12.2□□□□□ -0.46
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa12.19□□□□□ -0.46
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRL2O95490 1459 aa12.17□□□□□ -0.46
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO5BQ9ULV0 1848 aa12.17□□□□□ -0.46
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PGGT1B-201ENST00000296642 ADAMTS2O95450 1211 aa12.16□□□□□ -0.46
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PGGT1B-201ENST00000296642 NHSL1Q5SYE7 1610 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-201ENST00000296642 MST1RQ04912 1400 aa12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
PGGT1B-201ENST00000296642 PTCH1Q13635 1447 aa12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
PGGT1B-201ENST00000296642 UNC13BO14795 1591 aa12.11□□□□□ -0.47
PGGT1B-201ENST00000296642 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPRUQ92729 1446 aa12.1□□□□□ -0.47
PGGT1B-201ENST00000296642 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa12.09□□□□□ -0.47
PGGT1B-201ENST00000296642 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
PGGT1B-201ENST00000296642 E9PCH4 1651 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-201ENST00000296642 IQGAP3Q86VI3 1631 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-201ENST00000296642 C1orf167Q5SNV9 1468 aa12.07□□□□□ -0.48
PGGT1B-201ENST00000296642 NUP155O75694 1391 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-201ENST00000296642 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-201ENST00000296642 ATRNO75882 1429 aa12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
PGGT1B-201ENST00000296642 NPHP3Q7Z494 1330 aa12.06□□□□□ -0.48
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