RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.54■■■□□ 2.8
PKDCC-201ENST00000294964 MS4A1P11836 297 aa32.53■■■□□ 2.8
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PKDCC-201ENST00000294964 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
PKDCC-201ENST00000294964 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.51■■■□□ 2.79
PKDCC-201ENST00000294964 PLA2R1Q13018 1463 aa32.5■■■□□ 2.79
PKDCC-201ENST00000294964 RRP1P56182 461 aaKnown RBP32.5■■■□□ 2.79
PKDCC-201ENST00000294964 NFKBIBQ15653 356 aa32.5■■■□□ 2.79
PKDCC-201ENST00000294964 ERBINQ96RT1 1412 aa32.48■■■□□ 2.79
PKDCC-201ENST00000294964 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.47■■■□□ 2.79
PKDCC-201ENST00000294964 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.47■■■□□ 2.79
PKDCC-201ENST00000294964 PRAG1Q86YV5 1406 aa32.45■■■□□ 2.78
PKDCC-201ENST00000294964 DDRGK1Q96HY6 314 aa32.45■■■□□ 2.78
PKDCC-201ENST00000294964 A2MP01023 1474 aa32.4■■■□□ 2.78
PKDCC-201ENST00000294964 UNC13BO14795 1591 aa32.39■■■□□ 2.78
PKDCC-201ENST00000294964 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.39■■■□□ 2.78
PKDCC-201ENST00000294964 RSPH6AQ9H0K4 717 aa32.38■■■□□ 2.77
PKDCC-201ENST00000294964 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
PKDCC-201ENST00000294964 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
PKDCC-201ENST00000294964 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa32.36■■■□□ 2.77
PKDCC-201ENST00000294964 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP32.36■■■□□ 2.77
PKDCC-201ENST00000294964 SLC4A3P48751 1232 aa32.34■■■□□ 2.77
PKDCC-201ENST00000294964 DEPDC5O75140 1603 aa32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-201ENST00000294964 RCAN3Q9UKA8 241 aa32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-201ENST00000294964 DISP3Q9P2K9 1392 aa32.33■■■□□ 2.77
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.31■■■□□ 2.76
PKDCC-201ENST00000294964 SKAP1Q86WV1 359 aa32.31■■■□□ 2.76
PKDCC-201ENST00000294964 FAM43AQ8N2R8 423 aa32.31■■■□□ 2.76
PKDCC-201ENST00000294964 RALBP1Q15311 655 aa32.3■■■□□ 2.76
PKDCC-201ENST00000294964 TESK2Q96S53 571 aa32.29■■■□□ 2.76
PKDCC-201ENST00000294964 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-201ENST00000294964 KIF3BO15066 747 aa32.28■■■□□ 2.76
PKDCC-201ENST00000294964 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.27■■■□□ 2.76
PKDCC-201ENST00000294964 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
PKDCC-201ENST00000294964 ATP10AO60312 1499 aa32.26■■■□□ 2.76
PKDCC-201ENST00000294964 IQGAP3Q86VI3 1631 aa32.26■■■□□ 2.75
PKDCC-201ENST00000294964 PANK3Q9H999 370 aa32.26■■■□□ 2.75
PKDCC-201ENST00000294964 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
PKDCC-201ENST00000294964 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
PKDCC-201ENST00000294964 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
PKDCC-201ENST00000294964 E9PCH4 1651 aa32.24■■■□□ 2.75
PKDCC-201ENST00000294964 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
PKDCC-201ENST00000294964 REREQ9P2R6 1566 aa32.23■■■□□ 2.75
PKDCC-201ENST00000294964 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
PKDCC-201ENST00000294964 PKNOX2Q96KN3 472 aa32.2■■■□□ 2.75
PKDCC-201ENST00000294964 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.74
PKDCC-201ENST00000294964 VWDEQ8N2E2 1590 aa32.18■■■□□ 2.74
PKDCC-201ENST00000294964 NLRP13Q86W25 1043 aa32.18■■■□□ 2.74
PKDCC-201ENST00000294964 GPRASP1Q5JY77 1395 aa32.18■■■□□ 2.74
PKDCC-201ENST00000294964 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
PKDCC-201ENST00000294964 PARD3Q8TEW0 1356 aa32.16■■■□□ 2.74
PKDCC-201ENST00000294964 CDCA7LQ96GN5 454 aa32.14■■■□□ 2.74
PKDCC-201ENST00000294964 TMF1P82094 1093 aa32.13■■■□□ 2.73
PKDCC-201ENST00000294964 AGLP35573 1532 aa32.11■■■□□ 2.73
PKDCC-201ENST00000294964 CEP152O94986 1710 aa32.11■■■□□ 2.73
PKDCC-201ENST00000294964 GGT6Q6P531 493 aa32.1■■■□□ 2.73
PKDCC-201ENST00000294964 PLIN1O60240 522 aa32.1■■■□□ 2.73
PKDCC-201ENST00000294964 KANK1Q14678 1352 aa32.07■■■□□ 2.72
PKDCC-201ENST00000294964 TET3O43151 1660 aa32.07■■■□□ 2.72
PKDCC-201ENST00000294964 CRBNQ96SW2 442 aa32.06■■■□□ 2.72
PKDCC-201ENST00000294964 PDE3BQ13370 1112 aa32.03■■■□□ 2.72
PKDCC-201ENST00000294964 ABCC3O15438 1527 aa32.02■■■□□ 2.72
PKDCC-201ENST00000294964 LMTK2Q8IWU2 1503 aa32.02■■■□□ 2.72
PKDCC-201ENST00000294964 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.99■■■□□ 2.71
PKDCC-201ENST00000294964 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP31.97■■■□□ 2.71
PKDCC-201ENST00000294964 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
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PKDCC-201ENST00000294964 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.95■■■□□ 2.71
PKDCC-201ENST00000294964 LAMC1P11047 1609 aa31.95■■■□□ 2.71
PKDCC-201ENST00000294964 FAM161AQ3B820 660 aa31.95■■■□□ 2.7
PKDCC-201ENST00000294964 KDM2BQ8NHM5 1336 aa31.94■■■□□ 2.7
PKDCC-201ENST00000294964 ADAMTS8Q9UP79 889 aa31.93■■■□□ 2.7
PKDCC-201ENST00000294964 MLECQ14165 292 aa31.93■■■□□ 2.7
PKDCC-201ENST00000294964 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa31.92■■■□□ 2.7
PKDCC-201ENST00000294964 KNSTRNQ9Y448 316 aa31.92■■■□□ 2.7
PKDCC-201ENST00000294964 CLTCL1P53675 1640 aa31.91■■■□□ 2.7
PKDCC-201ENST00000294964 MADDQ8WXG6 1647 aa31.91■■■□□ 2.7
PKDCC-201ENST00000294964 UGGT1Q9NYU2 1555 aa31.9■■■□□ 2.7
PKDCC-201ENST00000294964 CFAP70Q5T0N1 1121 aa31.89■■■□□ 2.7
PKDCC-201ENST00000294964 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa31.89■■■□□ 2.7
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PKDCC-201ENST00000294964 TRPM2O94759 1503 aa31.86■■■□□ 2.69
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PKDCC-201ENST00000294964 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
PKDCC-201ENST00000294964 VSIG10Q8N0Z9 540 aa31.81■■■□□ 2.68
PKDCC-201ENST00000294964 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.81■■■□□ 2.68
PKDCC-201ENST00000294964 ZMYND15Q9H091 742 aa31.8■■■□□ 2.68
PKDCC-201ENST00000294964 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.79■■■□□ 2.68
PKDCC-201ENST00000294964 IQGAP1P46940 1657 aa31.79■■■□□ 2.68
PKDCC-201ENST00000294964 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
PKDCC-201ENST00000294964 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP31.76■■■□□ 2.67
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