RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291906.4

PKN3-201, Transcript of protein kinase N3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKN3, Length 3,375 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3-201ENST00000291906 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
PKN3-201ENST00000291906 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.63■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.63■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 STK26Q9P289 416 aa22.63■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 NEO1Q92859 1461 aa22.63■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 IDI1Q13907 227 aa22.61■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 ABCA6Q8N139 1617 aa22.61■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.61■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 TSPOAP1O95153 1857 aa22.61■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.6■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.6■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 NUDCQ9Y266 331 aa22.59■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 KIF1BO60333 1816 aa22.58■■□□□ 1.21
PKN3-201ENST00000291906 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
PKN3-201ENST00000291906 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.57■■□□□ 1.2
PKN3-201ENST00000291906 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PKN3-201ENST00000291906 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.56■■□□□ 1.2
PKN3-201ENST00000291906 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.56■■□□□ 1.2
PKN3-201ENST00000291906 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.56■■□□□ 1.2
PKN3-201ENST00000291906 LAMC1P11047 1609 aa22.54■■□□□ 1.2
PKN3-201ENST00000291906 ABCC3O15438 1527 aa22.54■■□□□ 1.2
PKN3-201ENST00000291906 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
PKN3-201ENST00000291906 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PKN3-201ENST00000291906 PPP2R1AP30153 589 aa22.52■■□□□ 1.2
PKN3-201ENST00000291906 MROH2AA6NES4 1674 aa22.52■■□□□ 1.2
PKN3-201ENST00000291906 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.52■■□□□ 1.2
PKN3-201ENST00000291906 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PKN3-201ENST00000291906 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.51■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.51■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.51■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.51■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.51■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.49■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 IQGAP1P46940 1657 aa22.48■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.48■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 MYOM2P54296 1465 aa22.47■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.46■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.46■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PKN3-201ENST00000291906 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.44■■□□□ 1.18
PKN3-201ENST00000291906 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.44■■□□□ 1.18
PKN3-201ENST00000291906 CABP2Q9NPB3 220 aa22.44■■□□□ 1.18
PKN3-201ENST00000291906 ADGRB3O60242 1522 aa22.43■■□□□ 1.18
PKN3-201ENST00000291906 RICTORQ6R327 1708 aa22.42■■□□□ 1.18
PKN3-201ENST00000291906 ERVK-7P63135 1459 aa22.42■■□□□ 1.18
PKN3-201ENST00000291906 SLC24A1O60721 1099 aa22.42■■□□□ 1.18
PKN3-201ENST00000291906 POGKQ9P215 609 aa22.42■■□□□ 1.18
PKN3-201ENST00000291906 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.41■■□□□ 1.18
PKN3-201ENST00000291906 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PKN3-201ENST00000291906 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PKN3-201ENST00000291906 PIK3C2GO75747 1445 aa22.4■■□□□ 1.18
PKN3-201ENST00000291906 MORC1Q86VD1 984 aa22.39■■□□□ 1.17
PKN3-201ENST00000291906 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.38■■□□□ 1.17
PKN3-201ENST00000291906 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.38■■□□□ 1.17
PKN3-201ENST00000291906 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.37■■□□□ 1.17
PKN3-201ENST00000291906 DIP2BQ9P265 1576 aa22.36■■□□□ 1.17
PKN3-201ENST00000291906 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.36■■□□□ 1.17
PKN3-201ENST00000291906 SYNMO15061 1565 aa22.36■■□□□ 1.17
PKN3-201ENST00000291906 EVC2Q86UK5 1308 aa22.35■■□□□ 1.17
PKN3-201ENST00000291906 PRAM1Q96QH2 718 aa22.34■■□□□ 1.17
PKN3-201ENST00000291906 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PKN3-201ENST00000291906 PLIN1O60240 522 aa22.34■■□□□ 1.17
PKN3-201ENST00000291906 NSD3Q9BZ95 1437 aa22.33■■□□□ 1.17
PKN3-201ENST00000291906 NEUROD2Q15784 382 aa22.33■■□□□ 1.17
PKN3-201ENST00000291906 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.32■■□□□ 1.16
PKN3-201ENST00000291906 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.32■■□□□ 1.16
PKN3-201ENST00000291906 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.32■■□□□ 1.16
PKN3-201ENST00000291906 GLI2P10070 1586 aa22.32■■□□□ 1.16
PKN3-201ENST00000291906 APAF1O14727 1248 aa22.31■■□□□ 1.16
PKN3-201ENST00000291906 IFT172Q9UG01 1749 aa22.31■■□□□ 1.16
PKN3-201ENST00000291906 PPLO60437 1756 aa22.31■■□□□ 1.16
PKN3-201ENST00000291906 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PKN3-201ENST00000291906 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.29■■□□□ 1.16
PKN3-201ENST00000291906 PDE3BQ13370 1112 aa22.29■■□□□ 1.16
PKN3-201ENST00000291906 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.29■■□□□ 1.16
PKN3-201ENST00000291906 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PKN3-201ENST00000291906 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.27■■□□□ 1.16
PKN3-201ENST00000291906 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.26■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.25■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 MYOM1P52179 1685 aa22.25■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 ADGRB1O14514 1584 aa22.25■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.24■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.24■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 PIK3C2BO00750 1634 aa22.24■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.24■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 MTHFSP49914 203 aa22.24■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.23■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.23■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.21■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PKN3-201ENST00000291906 GOLGA2Q08379 1002 aa22.21■■□□□ 1.15
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