RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 MROH2AA6NES4 1674 aa25.82■■□□□ 1.72
USP21-201ENST00000289865 ABCA6Q8N139 1617 aa25.82■■□□□ 1.72
USP21-201ENST00000289865 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
USP21-201ENST00000289865 SYNMO15061 1565 aa25.81■■□□□ 1.72
USP21-201ENST00000289865 CDCA8Q53HL2 280 aa25.8■■□□□ 1.72
USP21-201ENST00000289865 IFT172Q9UG01 1749 aa25.8■■□□□ 1.72
USP21-201ENST00000289865 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.79■■□□□ 1.72
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USP21-201ENST00000289865 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.78■■□□□ 1.72
USP21-201ENST00000289865 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.78■■□□□ 1.72
USP21-201ENST00000289865 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
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USP21-201ENST00000289865 MYOM1P52179 1685 aa25.76■■□□□ 1.71
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USP21-201ENST00000289865 ADGRB3O60242 1522 aa25.73■■□□□ 1.71
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USP21-201ENST00000289865 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.72■■□□□ 1.71
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USP21-201ENST00000289865 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
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USP21-201ENST00000289865 PDE3BQ13370 1112 aa25.7■■□□□ 1.7
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USP21-201ENST00000289865 NOS1P29475 1434 aa25.68■■□□□ 1.7
USP21-201ENST00000289865 PPP2R1AP30153 589 aa25.68■■□□□ 1.7
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USP21-201ENST00000289865 SLC24A1O60721 1099 aa25.63■■□□□ 1.69
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USP21-201ENST00000289865 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.63■■□□□ 1.69
USP21-201ENST00000289865 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.63■■□□□ 1.69
USP21-201ENST00000289865 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.61■■□□□ 1.69
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USP21-201ENST00000289865 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.61■■□□□ 1.69
USP21-201ENST00000289865 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.61■■□□□ 1.69
USP21-201ENST00000289865 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.59■■□□□ 1.69
USP21-201ENST00000289865 PIK3C2GO75747 1445 aa25.59■■□□□ 1.69
USP21-201ENST00000289865 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
USP21-201ENST00000289865 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.58■■□□□ 1.68
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USP21-201ENST00000289865 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.56■■□□□ 1.68
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USP21-201ENST00000289865 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.49■■□□□ 1.67
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USP21-201ENST00000289865 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.47■■□□□ 1.67
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USP21-201ENST00000289865 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.44■■□□□ 1.66
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USP21-201ENST00000289865 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.42■■□□□ 1.66
USP21-201ENST00000289865 PLIN1O60240 522 aa25.41■■□□□ 1.66
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USP21-201ENST00000289865 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.38■■□□□ 1.65
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USP21-201ENST00000289865 CRBNQ96SW2 442 aa25.32■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 MORC1Q86VD1 984 aa25.32■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.31■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 EVC2Q86UK5 1308 aa25.3■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.3■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 USP32Q8NFA0 1604 aa25.3■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 SLFN5Q08AF3 891 aa25.29■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 ZFYVE9O95405 1425 aa25.29■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.29■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.29■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.29■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.29■■□□□ 1.64
USP21-201ENST00000289865 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
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