RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 MADDQ8WXG6 1647 aa15.2■□□□□ 0.02
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GGPS1-201ENST00000282841 TRAK1Q9UPV9 953 aa15.19■□□□□ 0.02
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GGPS1-201ENST00000282841 EVC2Q86UK5 1308 aa14.88□□□□□ -0.03
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GGPS1-201ENST00000282841 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
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GGPS1-201ENST00000282841 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
GGPS1-201ENST00000282841 CDK19Q9BWU1 502 aa14.87□□□□□ -0.03
GGPS1-201ENST00000282841 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
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