RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273598.7

NICN1-201, Transcript of nicolin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NICN1, Length 2,616 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-201ENST00000273598 SLC52A1Q9NWF4 448 aa20.04■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa20.04■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.03■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 MRS2Q9HD23 443 aa20.03■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.03■□□□□ 0.8
NICN1-201ENST00000273598 CCDC184Q52MB2 194 aa20.02■□□□□ 0.8
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NICN1-201ENST00000273598 REREQ9P2R6 1566 aa20.01■□□□□ 0.79
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NICN1-201ENST00000273598 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa19.98■□□□□ 0.79
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NICN1-201ENST00000273598 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
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NICN1-201ENST00000273598 SLC24A1O60721 1099 aa19.91■□□□□ 0.78
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NICN1-201ENST00000273598 TMC1Q8TDI8 760 aa19.89■□□□□ 0.77
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NICN1-201ENST00000273598 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa19.86■□□□□ 0.77
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NICN1-201ENST00000273598 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
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NICN1-201ENST00000273598 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP19.69■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.69■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa19.69■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 ALKQ9UM73 1620 aa19.68■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa19.68■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 CARD14Q9BXL6 1004 aa19.67■□□□□ 0.74
NICN1-201ENST00000273598 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
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NICN1-201ENST00000273598 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
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NICN1-201ENST00000273598 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 FKBP8Q14318 412 aa19.62■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa19.61■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 PTPRMP28827 1452 aa19.61■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 TMEM2Q9UHN6 1383 aa19.61■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 TULP4Q9NRJ4 1543 aa19.6■□□□□ 0.73
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NICN1-201ENST00000273598 NSD3Q9BZ95 1437 aa19.59■□□□□ 0.73
NICN1-201ENST00000273598 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
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