RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264039.6

GPC1-201, Transcript of glypican 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPC1, Length 3,713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-201ENST00000264039 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.25■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 SLC24A1O60721 1099 aa20.24■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 SSFA2P28290 1259 aa20.24■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.24■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 CFAP53Q96M91 514 aa20.24■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.24■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 CBX1P83916 185 aa20.23■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa20.22■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.22■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 IGSF3O75054 1194 aa20.21■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.2■□□□□ 0.83
GPC1-201ENST00000264039 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.2■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 RLBP1P12271 317 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 USP19O94966 1318 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 FAM177BA6PVY3 158 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.19■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 MAP7D2Q96T17 732 aa20.18■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 FSD2A1L4K1 749 aa20.17■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 PTMSP20962 102 aa20.16■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 WWC1Q8IX03 1113 aa20.15■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 TSC1Q92574 1164 aa20.15■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.15■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
GPC1-201ENST00000264039 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.14■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.14■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 DAPK1P53355 1430 aa20.13■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 SYCE3A1L190 88 aa20.12■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.12■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 OFD1O75665 1012 aa20.11■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.11■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 KDM5BQ9UGL1 1544 aa20.1■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 TEX14Q8IWB6 1497 aa20.09■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 ABCC5O15440 1437 aa20.08■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
GPC1-201ENST00000264039 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.08■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 CASC1Q6TDU7 716 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 DRC7Q8IY82 874 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 KDM6BO15054 1643 aa20.07■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 RUNDC1Q96C34 613 aa20.04■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.04■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.04■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 MTHFSP49914 203 aa20.03■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.03■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.03■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.03■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 ST18O60284 1047 aa20.02■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.02■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 ERBINQ96RT1 1412 aa20.02■□□□□ 0.8
GPC1-201ENST00000264039 NUCB2P80303 420 aa20.01■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.01■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa20■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 TMEM57Q8N5G2 664 aa20■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 ZNF592Q92610 1267 aa20■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 NESP48681 1621 aa19.99■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 RIPK4P57078 832 aa19.99■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa19.99■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 RBSNQ9H1K0 784 aa19.99■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 SPC24Q8NBT2 197 aa19.99■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 SASS6Q6UVJ0 657 aa19.98■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 GDPD2Q9HCC8 539 aa19.98■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 TESK2Q96S53 571 aa19.98■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.98■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
GPC1-201ENST00000264039 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms