RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262033.10

PTGES3-201, Transcript of prostaglandin E synthase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGES3, Length 1,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGES3-201ENST00000262033 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.42■■□□□ 1.34
PTGES3-201ENST00000262033 MLECQ14165 292 aa23.42■■□□□ 1.34
PTGES3-201ENST00000262033 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.41■■□□□ 1.34
PTGES3-201ENST00000262033 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTGES3-201ENST00000262033 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PTGES3-201ENST00000262033 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.41■■□□□ 1.34
PTGES3-201ENST00000262033 ERVK-7P63135 1459 aa23.38■■□□□ 1.33
PTGES3-201ENST00000262033 CCER2I3L3R5 266 aa23.38■■□□□ 1.33
PTGES3-201ENST00000262033 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PTGES3-201ENST00000262033 TESK2Q96S53 571 aa23.37■■□□□ 1.33
PTGES3-201ENST00000262033 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.37■■□□□ 1.33
PTGES3-201ENST00000262033 PPLO60437 1756 aa23.36■■□□□ 1.33
PTGES3-201ENST00000262033 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PTGES3-201ENST00000262033 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PTGES3-201ENST00000262033 VGFO15240 615 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PTGES3-201ENST00000262033 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.33■■□□□ 1.32
PTGES3-201ENST00000262033 ZMYM3Q14202 1370 aa23.33■■□□□ 1.32
PTGES3-201ENST00000262033 IQGAP1P46940 1657 aa23.32■■□□□ 1.32
PTGES3-201ENST00000262033 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
PTGES3-201ENST00000262033 PIK3C2GO75747 1445 aa23.32■■□□□ 1.32
PTGES3-201ENST00000262033 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.31■■□□□ 1.32
PTGES3-201ENST00000262033 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.3■■□□□ 1.32
PTGES3-201ENST00000262033 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.3■■□□□ 1.32
PTGES3-201ENST00000262033 ZFYVE9O95405 1425 aa23.29■■□□□ 1.32
PTGES3-201ENST00000262033 TMF1P82094 1093 aa23.29■■□□□ 1.32
PTGES3-201ENST00000262033 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
PTGES3-201ENST00000262033 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa23.26■■□□□ 1.31
PTGES3-201ENST00000262033 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PTGES3-201ENST00000262033 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.26■■□□□ 1.31
PTGES3-201ENST00000262033 SLC24A1O60721 1099 aa23.23■■□□□ 1.31
PTGES3-201ENST00000262033 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PTGES3-201ENST00000262033 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.23■■□□□ 1.31
PTGES3-201ENST00000262033 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.22■■□□□ 1.31
PTGES3-201ENST00000262033 ADGRB1O14514 1584 aa23.2■■□□□ 1.3
PTGES3-201ENST00000262033 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.2■■□□□ 1.3
PTGES3-201ENST00000262033 CDCA8Q53HL2 280 aa23.19■■□□□ 1.3
PTGES3-201ENST00000262033 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.19■■□□□ 1.3
PTGES3-201ENST00000262033 TMEM132EQ6IEE7 984 aa23.17■■□□□ 1.3
PTGES3-201ENST00000262033 TNRQ92752 1358 aa23.15■■□□□ 1.3
PTGES3-201ENST00000262033 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa23.14■■□□□ 1.29
PTGES3-201ENST00000262033 TRAK1Q9UPV9 953 aa23.14■■□□□ 1.29
PTGES3-201ENST00000262033 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.13■■□□□ 1.29
PTGES3-201ENST00000262033 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PTGES3-201ENST00000262033 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
PTGES3-201ENST00000262033 RIMS2Q9UQ26 1411 aa23.11■■□□□ 1.29
PTGES3-201ENST00000262033 PANK3Q9H999 370 aa23.09■■□□□ 1.29
PTGES3-201ENST00000262033 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP23.08■■□□□ 1.29
PTGES3-201ENST00000262033 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
PTGES3-201ENST00000262033 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
PTGES3-201ENST00000262033 CCDC184Q52MB2 194 aa23.07■■□□□ 1.28
PTGES3-201ENST00000262033 HDGFP51858 240 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTGES3-201ENST00000262033 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PTGES3-201ENST00000262033 RALBP1Q15311 655 aa23.04■■□□□ 1.28
PTGES3-201ENST00000262033 ALKQ9UM73 1620 aa23.04■■□□□ 1.28
PTGES3-201ENST00000262033 NLRP1Q9C000 1473 aa23.04■■□□□ 1.28
PTGES3-201ENST00000262033 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa23.03■■□□□ 1.28
PTGES3-201ENST00000262033 MRS2Q9HD23 443 aa23.02■■□□□ 1.28
PTGES3-201ENST00000262033 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.02■■□□□ 1.28
PTGES3-201ENST00000262033 C3P01024 1663 aa23.02■■□□□ 1.27
PTGES3-201ENST00000262033 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTGES3-201ENST00000262033 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PTGES3-201ENST00000262033 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23■■□□□ 1.27
PTGES3-201ENST00000262033 QRICH2Q9H0J4 1663 aa23■■□□□ 1.27
PTGES3-201ENST00000262033 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTGES3-201ENST00000262033 STK26Q9P289 416 aa22.99■■□□□ 1.27
PTGES3-201ENST00000262033 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.99■■□□□ 1.27
PTGES3-201ENST00000262033 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PTGES3-201ENST00000262033 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PTGES3-201ENST00000262033 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.97■■□□□ 1.27
PTGES3-201ENST00000262033 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PTGES3-201ENST00000262033 MYOM1P52179 1685 aa22.95■■□□□ 1.27
PTGES3-201ENST00000262033 PTPRMP28827 1452 aa22.95■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.95■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 EVC2Q86UK5 1308 aa22.94■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 PRAM1Q96QH2 718 aa22.92■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa22.91■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.9■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.9■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 TMC1Q8TDI8 760 aa22.9■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 POGKQ9P215 609 aa22.9■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 ABCC11Q96J66 1382 aa22.9■■□□□ 1.26
PTGES3-201ENST00000262033 LTKP29376 864 aa22.89■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.88■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 DLC1Q96QB1 1528 aa22.88■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.88■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 NLRP13Q86W25 1043 aa22.88■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 METP08581 1390 aa22.87■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.87■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa22.87■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 CARD14Q9BXL6 1004 aa22.86■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 EID1Q9Y6B2 187 aa22.86■■□□□ 1.25
PTGES3-201ENST00000262033 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms