RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258341.4

LAMC1-201, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LAMC1, Length 7,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-201ENST00000258341 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 CPLX1O14810 134 aa20.08■□□□□ 0.81
LAMC1-201ENST00000258341 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.08■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.08■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.07■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 RUFY1Q96T51 708 aa20.07■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.06■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.06■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.06■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 COG3Q96JB2 828 aa20.05■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.04■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 FOSBP53539 338 aa20.04■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 TEX35Q5T0J7 233 aa20.04■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.83e-7■■■■■ 30.4
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LAMC1-201ENST00000258341 FYB1O15117 783 aa20.03■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 PSME1Q06323 249 aa20.02■□□□□ 0.8
LAMC1-201ENST00000258341 BICD2Q8TD16 824 aa20.02■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 AK7Q96M32 723 aa20.01■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 PAF1Q8N7H5 531 aa20.01■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.01■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 WWC2Q6AWC2 1192 aa20■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC27Q2M243 656 aa20■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 IKQ13123 557 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa19.99■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 DDX58O95786 925 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 RNF20Q5VTR2 975 aa19.98■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 SASS6Q6UVJ0 657 aa19.97■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 MTMR7Q9Y216 660 aa19.96■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.96■□□□□ 0.79
LAMC1-201ENST00000258341 REC8O95072 547 aa19.95■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 CDR1P51861 262 aa19.95■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 KIF15Q9NS87 1388 aa19.95■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 NLRP13Q86W25 1043 aa19.95■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 MAP7D2Q96T17 732 aa19.95■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 ABCC8Q09428 1581 aa19.94■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP19.94■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC173Q0VFZ6 552 aa19.94■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 OFD1O75665 1012 aa19.93■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 BRMS1Q9HCU9 246 aa19.93■□□□□ 0.78
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LAMC1-201ENST00000258341 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.91■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa19.9■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 SLC4A3P48751 1232 aa19.9■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 FMN1Q68DA7 1419 aa19.9■□□□□ 0.78
LAMC1-201ENST00000258341 CAGE1Q8TC20 777 aa19.89■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 FAM161AQ3B820 660 aa19.89■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 OLFM4Q6UX06 510 aa19.89■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 SKIDA1Q1XH10 827 aa19.89■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 PDE3BQ13370 1112 aa19.88■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 TTLL5Q6EMB2 1281 aa19.88■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 SMC3Q9UQE7 1217 aa19.88■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 PANK3Q9H999 370 aa19.88■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 MYO6Q9UM54 1294 aa19.88■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 PDILTQ8N807 584 aa19.87■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 XBP1P17861 261 aa19.87■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 KDM4AO75164 1064 aa19.87■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 RIC3Q7Z5B4 369 aa19.87■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 NEUROD6Q96NK8 337 aa19.86■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 VSIG10Q8N0Z9 540 aa19.86■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 ACBD3Q9H3P7 528 aa19.86■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.86■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 WASHC4Q2M389 1173 aa19.86■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 IFT57Q9NWB7 429 aa19.85■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 E9PSI1 815 aa19.84■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 ATF3P18847 181 aa19.84■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.84■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 MNS1Q8NEH6 495 aa19.83■□□□□ 0.77
LAMC1-201ENST00000258341 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
LAMC1-201ENST00000258341 SYCP1Q15431 976 aa19.83■□□□□ 0.76
LAMC1-201ENST00000258341 HSP90B2PQ58FF3 399 aa19.83■□□□□ 0.76
LAMC1-201ENST00000258341 SOGA1O94964 1423 aa19.82■□□□□ 0.76
LAMC1-201ENST00000258341 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa19.82■□□□□ 0.76
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