RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253099.10

MRPL4-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MRPL4, Length 1,455 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4-201ENST00000253099 ANKLE2Q86XL3 938 aa36.26■■■■□ 3.4
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MRPL4-201ENST00000253099 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
MRPL4-201ENST00000253099 EID1Q9Y6B2 187 aa36.24■■■■□ 3.39
MRPL4-201ENST00000253099 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa36.24■■■■□ 3.39
MRPL4-201ENST00000253099 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.24■■■■□ 3.39
MRPL4-201ENST00000253099 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa36.23■■■■□ 3.39
MRPL4-201ENST00000253099 HDGFP51858 240 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
MRPL4-201ENST00000253099 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
MRPL4-201ENST00000253099 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP36.2■■■■□ 3.39
MRPL4-201ENST00000253099 STRCQ7RTU9 1775 aa36.19■■■■□ 3.38
MRPL4-201ENST00000253099 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
MRPL4-201ENST00000253099 PPLO60437 1756 aa36.17■■■■□ 3.38
MRPL4-201ENST00000253099 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
MRPL4-201ENST00000253099 IFT172Q9UG01 1749 aa36.14■■■■□ 3.38
MRPL4-201ENST00000253099 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.14■■■■□ 3.38
MRPL4-201ENST00000253099 VGFO15240 615 aaPredicted RBP36.13■■■■□ 3.37
MRPL4-201ENST00000253099 L3MBTL2Q969R5 705 aa36.13■■■■□ 3.37
MRPL4-201ENST00000253099 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
MRPL4-201ENST00000253099 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.11■■■■□ 3.37
MRPL4-201ENST00000253099 MED14O60244 1454 aa36.1■■■■□ 3.37
MRPL4-201ENST00000253099 TONSLQ96HA7 1378 aa36.09■■■■□ 3.37
MRPL4-201ENST00000253099 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa36.08■■■■□ 3.37
MRPL4-201ENST00000253099 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa36.08■■■■□ 3.37
MRPL4-201ENST00000253099 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.37
MRPL4-201ENST00000253099 BCANQ96GW7 911 aa36.05■■■■□ 3.36
MRPL4-201ENST00000253099 MYOM2P54296 1465 aa36.04■■■■□ 3.36
MRPL4-201ENST00000253099 STAC3Q96MF2 364 aa36.03■■■■□ 3.36
MRPL4-201ENST00000253099 IQGAP1P46940 1657 aa36.02■■■■□ 3.36
MRPL4-201ENST00000253099 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.99■■■■□ 3.35
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MRPL4-201ENST00000253099 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.98■■■■□ 3.35
MRPL4-201ENST00000253099 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa35.97■■■■□ 3.35
MRPL4-201ENST00000253099 PIK3C2GO75747 1445 aa35.96■■■■□ 3.35
MRPL4-201ENST00000253099 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa35.95■■■■□ 3.35
MRPL4-201ENST00000253099 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa35.95■■■■□ 3.35
MRPL4-201ENST00000253099 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa35.94■■■■□ 3.34
MRPL4-201ENST00000253099 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.89■■■■□ 3.34
MRPL4-201ENST00000253099 TBX22Q9Y458 520 aa35.89■■■■□ 3.34
MRPL4-201ENST00000253099 ALKQ9UM73 1620 aa35.88■■■■□ 3.33
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MRPL4-201ENST00000253099 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
MRPL4-201ENST00000253099 DIP2AQ14689 1571 aa35.85■■■■□ 3.33
MRPL4-201ENST00000253099 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.83■■■■□ 3.33
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MRPL4-201ENST00000253099 METP08581 1390 aa35.81■■■■□ 3.32
MRPL4-201ENST00000253099 LAMC1P11047 1609 aa35.77■■■■□ 3.32
MRPL4-201ENST00000253099 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.76■■■■□ 3.32
MRPL4-201ENST00000253099 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
MRPL4-201ENST00000253099 PIK3R4Q99570 1358 aa35.73■■■■□ 3.31
MRPL4-201ENST00000253099 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa35.73■■■■□ 3.31
MRPL4-201ENST00000253099 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.72■■■■□ 3.31
MRPL4-201ENST00000253099 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.72■■■■□ 3.31
MRPL4-201ENST00000253099 PTPRUQ92729 1446 aa35.72■■■■□ 3.31
MRPL4-201ENST00000253099 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.7■■■■□ 3.31
MRPL4-201ENST00000253099 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.3
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MRPL4-201ENST00000253099 ADGRB1O14514 1584 aa35.68■■■■□ 3.3
MRPL4-201ENST00000253099 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.67■■■■□ 3.3
MRPL4-201ENST00000253099 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.66■■■■□ 3.3
MRPL4-201ENST00000253099 STK26Q9P289 416 aa35.64■■■■□ 3.3
MRPL4-201ENST00000253099 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
MRPL4-201ENST00000253099 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
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MRPL4-201ENST00000253099 NWD1Q149M9 1564 aa35.62■■■■□ 3.29
MRPL4-201ENST00000253099 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
MRPL4-201ENST00000253099 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
MRPL4-201ENST00000253099 ABCC11Q96J66 1382 aa35.58■■■■□ 3.29
MRPL4-201ENST00000253099 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.56■■■■□ 3.28
MRPL4-201ENST00000253099 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.56■■■■□ 3.28
MRPL4-201ENST00000253099 TRAK1Q9UPV9 953 aa35.54■■■■□ 3.28
MRPL4-201ENST00000253099 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
MRPL4-201ENST00000253099 TECPR2O15040 1411 aa35.53■■■■□ 3.28
MRPL4-201ENST00000253099 CARD11Q9BXL7 1154 aa35.53■■■■□ 3.28
MRPL4-201ENST00000253099 ROBO2Q9HCK4 1378 aa35.52■■■■□ 3.28
MRPL4-201ENST00000253099 CPS1P31327 1500 aa35.51■■■■□ 3.28
MRPL4-201ENST00000253099 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.28
MRPL4-201ENST00000253099 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.5■■■■□ 3.27
MRPL4-201ENST00000253099 PTCH1Q13635 1447 aa35.5■■■■□ 3.27
MRPL4-201ENST00000253099 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
MRPL4-201ENST00000253099 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.47■■■■□ 3.27
MRPL4-201ENST00000253099 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
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MRPL4-201ENST00000253099 DLC1Q96QB1 1528 aa35.46■■■■□ 3.27
MRPL4-201ENST00000253099 SIRT1Q96EB6 747 aa35.45■■■■□ 3.27
MRPL4-201ENST00000253099 TMEM94Q12767 1356 aa35.44■■■■□ 3.26
MRPL4-201ENST00000253099 PRAM1Q96QH2 718 aa35.43■■■■□ 3.26
MRPL4-201ENST00000253099 FAM135BQ49AJ0 1406 aa35.43■■■■□ 3.26
MRPL4-201ENST00000253099 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.42■■■■□ 3.26
MRPL4-201ENST00000253099 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
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MRPL4-201ENST00000253099 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP35.38■■■■□ 3.25
MRPL4-201ENST00000253099 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
MRPL4-201ENST00000253099 C14orf37Q86TY3 774 aa35.34■■■■□ 3.25
MRPL4-201ENST00000253099 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
MRPL4-201ENST00000253099 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.33■■■■□ 3.25
MRPL4-201ENST00000253099 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP35.32■■■■□ 3.24
MRPL4-201ENST00000253099 USP47Q96K76 1375 aa35.32■■■■□ 3.24
MRPL4-201ENST00000253099 CERKQ8TCT0 537 aa35.3■■■■□ 3.24
MRPL4-201ENST00000253099 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
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