RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252771.11

FCHO1-201, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,118 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-201ENST00000252771 FKBP8Q14318 412 aa23.24■■□□□ 1.31
FCHO1-201ENST00000252771 CFAP70Q5T0N1 1121 aa23.22■■□□□ 1.31
FCHO1-201ENST00000252771 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.22■■□□□ 1.31
FCHO1-201ENST00000252771 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
FCHO1-201ENST00000252771 RALBP1Q15311 655 aa23.21■■□□□ 1.31
FCHO1-201ENST00000252771 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.2■■□□□ 1.3
FCHO1-201ENST00000252771 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
FCHO1-201ENST00000252771 TSPOAP1O95153 1857 aa23.19■■□□□ 1.3
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FCHO1-201ENST00000252771 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.19■■□□□ 1.3
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FCHO1-201ENST00000252771 PPLO60437 1756 aa23.17■■□□□ 1.3
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FCHO1-201ENST00000252771 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.16■■□□□ 1.3
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FCHO1-201ENST00000252771 PIK3C2GO75747 1445 aa23.11■■□□□ 1.29
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FCHO1-201ENST00000252771 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.05■■□□□ 1.28
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FCHO1-201ENST00000252771 ADGRB1O14514 1584 aa23.05■■□□□ 1.28
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FCHO1-201ENST00000252771 REREQ9P2R6 1566 aa22.99■■□□□ 1.27
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FCHO1-201ENST00000252771 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-201ENST00000252771 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-201ENST00000252771 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.98■■□□□ 1.27
FCHO1-201ENST00000252771 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.98■■□□□ 1.27
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FCHO1-201ENST00000252771 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.89■■□□□ 1.26
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FCHO1-201ENST00000252771 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.86■■□□□ 1.25
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FCHO1-201ENST00000252771 MLECQ14165 292 aa22.83■■□□□ 1.25
FCHO1-201ENST00000252771 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
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FCHO1-201ENST00000252771 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.8■■□□□ 1.24
FCHO1-201ENST00000252771 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.8■■□□□ 1.24
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FCHO1-201ENST00000252771 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.8■■□□□ 1.24
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FCHO1-201ENST00000252771 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.73■■□□□ 1.23
FCHO1-201ENST00000252771 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-201ENST00000252771 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
FCHO1-201ENST00000252771 PDE3BQ13370 1112 aa22.71■■□□□ 1.23
FCHO1-201ENST00000252771 ZMYM3Q14202 1370 aa22.71■■□□□ 1.23
FCHO1-201ENST00000252771 CABP2Q9NPB3 220 aa22.71■■□□□ 1.23
FCHO1-201ENST00000252771 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
FCHO1-201ENST00000252771 USP32Q8NFA0 1604 aa22.67■■□□□ 1.22
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