RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 BCANQ96GW7 911 aa31.59■■■□□ 2.65
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CITED1-201ENST00000246139 ADGRB3O60242 1522 aa31.56■■■□□ 2.64
CITED1-201ENST00000246139 E9PCH4 1651 aa31.55■■■□□ 2.64
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CITED1-201ENST00000246139 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP31.53■■■□□ 2.64
CITED1-201ENST00000246139 TMEM94Q12767 1356 aa31.53■■■□□ 2.64
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CITED1-201ENST00000246139 KCNA6P17658 529 aa31.52■■■□□ 2.64
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CITED1-201ENST00000246139 FAM135BQ49AJ0 1406 aa31.44■■■□□ 2.62
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CITED1-201ENST00000246139 TRIM52Q96A61 297 aa31.44■■■□□ 2.62
CITED1-201ENST00000246139 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP31.43■■■□□ 2.62
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CITED1-201ENST00000246139 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa31.42■■■□□ 2.62
CITED1-201ENST00000246139 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
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CITED1-201ENST00000246139 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
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CITED1-201ENST00000246139 SLAIN2Q9P270 581 aa31.25■■■□□ 2.59
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CITED1-201ENST00000246139 CLTCL1P53675 1640 aa31.2■■■□□ 2.58
CITED1-201ENST00000246139 PHLPP1O60346 1717 aa31.19■■■□□ 2.58
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CITED1-201ENST00000246139 SETD5Q9C0A6 1442 aa31.15■■■□□ 2.58
CITED1-201ENST00000246139 C14orf37Q86TY3 774 aa31.15■■■□□ 2.58
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CITED1-201ENST00000246139 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.14■■■□□ 2.58
CITED1-201ENST00000246139 DIP2AQ14689 1571 aa31.13■■■□□ 2.57
CITED1-201ENST00000246139 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
CITED1-201ENST00000246139 PIK3R4Q99570 1358 aa31.12■■■□□ 2.57
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CITED1-201ENST00000246139 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
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CITED1-201ENST00000246139 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa31.11■■■□□ 2.57
CITED1-201ENST00000246139 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa31.11■■■□□ 2.57
CITED1-201ENST00000246139 JCADQ9P266 1359 aa31.07■■■□□ 2.56
CITED1-201ENST00000246139 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa31.07■■■□□ 2.56
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CITED1-201ENST00000246139 C19orf44Q9H6X5 657 aa31.05■■■□□ 2.56
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CITED1-201ENST00000246139 CADPS2Q86UW7 1296 aa31.01■■■□□ 2.55
CITED1-201ENST00000246139 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa31■■■□□ 2.55
CITED1-201ENST00000246139 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa31■■■□□ 2.55
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CITED1-201ENST00000246139 METP08581 1390 aa30.99■■■□□ 2.55
CITED1-201ENST00000246139 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.98■■■□□ 2.55
CITED1-201ENST00000246139 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
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CITED1-201ENST00000246139 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.54
CITED1-201ENST00000246139 BRINP3Q76B58 766 aa30.94■■■□□ 2.54
CITED1-201ENST00000246139 SHPRHQ149N8 1683 aa30.9■■■□□ 2.54
CITED1-201ENST00000246139 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa30.9■■■□□ 2.54
CITED1-201ENST00000246139 HRCP23327 699 aa30.87■■■□□ 2.53
CITED1-201ENST00000246139 DCCP43146 1447 aa30.87■■■□□ 2.53
CITED1-201ENST00000246139 MST1RQ04912 1400 aa30.86■■■□□ 2.53
CITED1-201ENST00000246139 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa30.86■■■□□ 2.53
CITED1-201ENST00000246139 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa30.85■■■□□ 2.53
CITED1-201ENST00000246139 PPLO60437 1756 aa30.84■■■□□ 2.53
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CITED1-201ENST00000246139 NALCNQ8IZF0 1738 aa30.81■■■□□ 2.52
CITED1-201ENST00000246139 NHSL1Q5SYE7 1610 aa30.8■■■□□ 2.52
CITED1-201ENST00000246139 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
CITED1-201ENST00000246139 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa30.79■■■□□ 2.52
CITED1-201ENST00000246139 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.79■■■□□ 2.52
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CITED1-201ENST00000246139 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
CITED1-201ENST00000246139 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
CITED1-201ENST00000246139 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
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CITED1-201ENST00000246139 STK26Q9P289 416 aa30.72■■■□□ 2.51
CITED1-201ENST00000246139 PTCH1Q13635 1447 aa30.7■■■□□ 2.5
CITED1-201ENST00000246139 IFT172Q9UG01 1749 aa30.7■■■□□ 2.5
CITED1-201ENST00000246139 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.67■■■□□ 2.5
CITED1-201ENST00000246139 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
CITED1-201ENST00000246139 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.66■■■□□ 2.5
CITED1-201ENST00000246139 AFF2P51816 1311 aa30.66■■■□□ 2.5
CITED1-201ENST00000246139 PNPLA6Q8IY17 1366 aa30.66■■■□□ 2.5
CITED1-201ENST00000246139 PIK3C2GO75747 1445 aa30.64■■■□□ 2.5
CITED1-201ENST00000246139 RXRBP28702 533 aa30.63■■■□□ 2.49
CITED1-201ENST00000246139 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP30.63■■■□□ 2.49
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