RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.55□□□□□ -0.08
PRRX1-201ENST00000239461 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.55□□□□□ -0.08
PRRX1-201ENST00000239461 CCER2I3L3R5 266 aa14.53□□□□□ -0.08
PRRX1-201ENST00000239461 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.53□□□□□ -0.08
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.52□□□□□ -0.08
PRRX1-201ENST00000239461 NPATQ14207 1427 aa14.52□□□□□ -0.08
PRRX1-201ENST00000239461 MYOM2P54296 1465 aa14.51□□□□□ -0.09
PRRX1-201ENST00000239461 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.51□□□□□ -0.09
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.5□□□□□ -0.09
PRRX1-201ENST00000239461 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PRRX1-201ENST00000239461 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.5□□□□□ -0.09
PRRX1-201ENST00000239461 RAPGEF3O95398 923 aa14.49□□□□□ -0.09
PRRX1-201ENST00000239461 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
PRRX1-201ENST00000239461 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.48□□□□□ -0.09
PRRX1-201ENST00000239461 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.48□□□□□ -0.09
PRRX1-201ENST00000239461 C3P01024 1663 aa14.47□□□□□ -0.09
PRRX1-201ENST00000239461 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa14.46□□□□□ -0.09
PRRX1-201ENST00000239461 KIF3BO15066 747 aa14.46□□□□□ -0.09
PRRX1-201ENST00000239461 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.46□□□□□ -0.09
PRRX1-201ENST00000239461 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.46□□□□□ -0.1
PRRX1-201ENST00000239461 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa14.45□□□□□ -0.1
PRRX1-201ENST00000239461 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.45□□□□□ -0.1
PRRX1-201ENST00000239461 MRS2Q9HD23 443 aa14.45□□□□□ -0.1
PRRX1-201ENST00000239461 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.44□□□□□ -0.1
PRRX1-201ENST00000239461 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
PRRX1-201ENST00000239461 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.43□□□□□ -0.1
PRRX1-201ENST00000239461 ERVK-7P63135 1459 aa14.43□□□□□ -0.1
PRRX1-201ENST00000239461 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
PRRX1-201ENST00000239461 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.42□□□□□ -0.1
PRRX1-201ENST00000239461 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.41□□□□□ -0.1
PRRX1-201ENST00000239461 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
PRRX1-201ENST00000239461 USP47Q96K76 1375 aa14.4□□□□□ -0.1
PRRX1-201ENST00000239461 ZBTB7CA1YPR0 619 aa14.4□□□□□ -0.1
PRRX1-201ENST00000239461 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.39□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.38□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 CDCA8Q53HL2 280 aa14.38□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 TMC1Q8TDI8 760 aa14.38□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.38□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 GGT6Q6P531 493 aa14.37□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 ADGRB1O14514 1584 aa14.37□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 ZFYVE9O95405 1425 aa14.37□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC7Q96M83 1385 aa14.36□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 WASHC2AQ641Q2 1341 aa14.36□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 TMF1P82094 1093 aa14.35□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 KNDC1Q76NI1 1749 aa14.35□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 STAC3Q96MF2 364 aa14.34□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 MYOM1P52179 1685 aa14.34□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 PIK3C2GO75747 1445 aa14.34□□□□□ -0.11
PRRX1-201ENST00000239461 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa14.32□□□□□ -0.12
PRRX1-201ENST00000239461 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa14.32□□□□□ -0.12
PRRX1-201ENST00000239461 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.32□□□□□ -0.12
PRRX1-201ENST00000239461 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.3□□□□□ -0.12
PRRX1-201ENST00000239461 FKBP8Q14318 412 aa14.29□□□□□ -0.12
PRRX1-201ENST00000239461 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
PRRX1-201ENST00000239461 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.12
PRRX1-201ENST00000239461 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.27□□□□□ -0.12
PRRX1-201ENST00000239461 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.26□□□□□ -0.13
PRRX1-201ENST00000239461 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
PRRX1-201ENST00000239461 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.26□□□□□ -0.13
PRRX1-201ENST00000239461 SLIT1O75093 1534 aa14.26□□□□□ -0.13
PRRX1-201ENST00000239461 RALBP1Q15311 655 aa14.24□□□□□ -0.13
PRRX1-201ENST00000239461 NLRP1Q9C000 1473 aa14.23□□□□□ -0.13
PRRX1-201ENST00000239461 ARHGAP23Q9P227 1491 aa14.23□□□□□ -0.13
PRRX1-201ENST00000239461 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa14.23□□□□□ -0.13
PRRX1-201ENST00000239461 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PRRX1-201ENST00000239461 ZMYM3Q14202 1370 aa14.21□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 ALKQ9UM73 1620 aa14.21□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 PTPRMP28827 1452 aa14.21□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 DLC1Q96QB1 1528 aa14.2□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.2□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.19□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 MED14O60244 1454 aa14.18□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP14.18□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 DIP2AQ14689 1571 aa14.18□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.18□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 CPS1P31327 1500 aa14.17□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.17□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 USP32Q8NFA0 1604 aa14.17□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PRRX1-201ENST00000239461 NLRP13Q86W25 1043 aa14.14□□□□□ -0.15
PRRX1-201ENST00000239461 ADGRB2O60241 1585 aa14.14□□□□□ -0.15
PRRX1-201ENST00000239461 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
PRRX1-201ENST00000239461 IDI1Q13907 227 aa14.12□□□□□ -0.15
PRRX1-201ENST00000239461 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa14.12□□□□□ -0.15
PRRX1-201ENST00000239461 PANK3Q9H999 370 aa14.12□□□□□ -0.15
PRRX1-201ENST00000239461 TESK2Q96S53 571 aa14.11□□□□□ -0.15
PRRX1-201ENST00000239461 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PRRX1-201ENST00000239461 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.11□□□□□ -0.15
PRRX1-201ENST00000239461 TNRQ92752 1358 aa14.11□□□□□ -0.15
PRRX1-201ENST00000239461 TECPR2O15040 1411 aa14.11□□□□□ -0.15
PRRX1-201ENST00000239461 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
PRRX1-201ENST00000239461 POGKQ9P215 609 aa14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms