RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	YMR074C	Q04773	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	LIP2	Q06005	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SOR2	Q07786	357 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.61	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SIR2	P06700	562 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YER039C-A	P0CD97	72 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	URA10	P30402	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TKL2	P33315	681 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	THI80	P35202	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	ASK1	P35734	292 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	NNK1	P36003	928 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YHR033W	P38690	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	PRM5	P40476	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	CAT5	P41735	233 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MTL1	P53214	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	ABF2	Q02486	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	BLS1	Q06071	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SUE1	Q06524	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	PFA4	Q12006	378 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	COX1	P00401	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	RPB10	P22139	70 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	MIX23	P38162	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TRR2	P38816	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	AZF1	P41696	914 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YFL065C	P43539	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YFL012W	P43580	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	BNA2	P47125	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	GAS3	Q03655	524 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YMR206W	Q03695	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TSA2	Q04120	196 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	CTR3	Q06686	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YPR203W	Q08994	102 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	POM34	Q12445	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YEL076C	P39971	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	SPO73	P40031	143 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TTI2	P47168	421 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	VHT1	P53241	593 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YNL143C	P53908	130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	LSM3	P57743	89 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YML053C	Q04978	212 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YDL157C	Q12082	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	YLR118C	Q12354	227 aa		4.59	□□□□□ -1.67
EXO1	YOR033C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	CPT1	P17898	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	CPR2	P23285	205 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	DRE2	P36152	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	UME6	P39001	836 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	PSD1	P39006	500 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	PEX7	P39108	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	SPC25	P40014	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	SNO3	P43544	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	XPT1	P47165	209 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	BNS1	P50084	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	SCS3	P53012	380 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YNR048W	P53740	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	SNO2	P53823	222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	PDR17	P53844	350 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	DUG3	P53871	357 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YNL165W	P53891	406 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	ATG41	Q12048	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	ORT1	Q12375	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	POX1	P13711	748 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YKL187C	P34231	750 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	MRPS9	P38120	278 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YNL198C	P40166	100 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	AYR1	P40471	297 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YOR029W	Q12243	111 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YLR415C	O13578	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	STE7	P06784	515 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	CTA1	P15202	515 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	MAK31	P23059	88 aa		4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
EXO1	YOR033C	YCR099C	P25657	155 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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