RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 SP100P23497 879 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 LIN9Q5TKA1 542 aa24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 LILRA6Q6PI73 481 aa24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 APPL2Q8NEU8 664 aa24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 PAGE5Q96GU1 130 aa24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 CBWD1Q9BRT8 395 aa24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 HPSEQ9Y251 543 aa24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 CDY1Q9Y6F8 540 aa24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 TCHHQ07283 1943 aa24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 A0A1W2PQ27 194 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 A0A1W2PQ64 194 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 A0A1W2PQD8 194 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 H7C4K7 107 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 IL18RAPO95256 599 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 GUCY2FP51841 1108 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 RNF135Q8IUD6 432 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 PCIF1Q9H4Z3 704 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 EPHX3Q9H6B9 360 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 VWA8A3KMH1 1905 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 PI4K2BG5E9Z4 385 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 EXTL3O43909 919 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 RFPL2O75678 378 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 NDUFA8P51970 172 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 RAB33AQ14088 237 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 CYP26C1Q6V0L0 522 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 FSIP1Q8NA03 581 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 ZNF507Q8TCN5 953 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 PIDD1Q9HB75 910 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 FBXW11Q9UKB1 542 aa24.25■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 UBE4BO95155 1302 aa24.24■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 ADAM12O43184 909 aa24.24■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 DCXO43602 365 aa24.24■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 MYL1P05976 194 aa24.24■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 DSTYKQ6XUX3 929 aa24.24■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 CCDC149Q6ZUS6 474 aa24.24■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 BRSK2Q8IWQ3 736 aa24.24■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 GPD1LQ8N335 351 aa24.24■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.24■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 SLC39A2Q9NP94 309 aa24.24■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 EXOC1Q9NV70 894 aa24.24■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 GOLGA8IPA6NC78 632 aa24.23■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa24.23■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 GOLGA8JA6NMD2 632 aa24.23■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 EHHADHQ08426 723 aa24.23■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 C9orf57Q5W0N0 161 aa24.23■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 ZNF280DQ6N043 979 aa24.23■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 PCDHB8Q9UN66 801 aa24.23■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 PLXNA3P51805 1871 aa24.23■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 ZMYND10O75800 440 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 PAX3P23760 479 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 CTXN3Q4LDR2 81 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 HS2ST1Q7LGA3 356 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 USP37Q86T82 979 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 NELFCDQ8IXH7 590 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 CCDC34Q96HJ3 373 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 DPP3Q9NY33 737 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 MUTYHQ9UIF7 546 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 USTQ9Y2C2 406 aa24.22■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 M0QZQ0 153 aa24.21■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 C8AP07357 584 aa24.21■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 PPM1LQ5SGD2 360 aa24.21■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 SLC8B1Q6J4K2 584 aa24.21■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 SCFD1Q8WVM8 642 aa24.21■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 PRKD2Q9BZL6 878 aa24.21■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 HOXD13P35453 343 aa24.2■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 ARPP19P56211 112 aa24.2■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 LILRA4P59901 499 aa24.2■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 UVSSAQ2YD98 709 aa24.2■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 EFCAB13Q8IY85 973 aa24.2■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 FEZF2Q8TBJ5 459 aa24.2■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.2■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 ARHGEF37A1IGU5 675 aa24.2■■□□□ 1.46
SYT6-210ENST00000641643 ZNF233A6NK53 670 aa24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms