RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 MGAMO43451 1857 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 WDR90Q96KV7 1748 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 MYBL1P10243 752 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 CD58P19256 250 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 KLRC2P26717 231 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 PIK3CAP42336 1068 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 SLC1A1P43005 524 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 MNAT1P51948 309 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 MTERF2Q49AM1 385 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF677Q86XU0 584 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.21□□□□□ -0.13
C9orf170-201ENST00000623052 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CUL2Q13617 745 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM132BQ14DG7 1078 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 EMC2Q15006 297 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CGB2Q6NT52 195 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 FAM212AQ96EL1 285 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 SERPINB12Q96P63 405 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 SLC9A2Q9UBY0 812 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 NFASCO94856 1347 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 PSAPP07602 524 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 GLRA2P23416 452 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CDR1P51861 262 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 SEZ6Q53EL9 994 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 SNX3O60493 162 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ATF2P15336 505 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 LIG4P49917 911 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CROCCP2Q86T23 111 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 P3H4Q92791 437 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TRAIPQ9BWF2 469 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CNTN6Q9UQ52 1028 aa14.2□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 PSTPIP1O43586 416 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TNNI1P19237 187 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 GCAP28676 217 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 BACE1P56817 501 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM270Q6UE05 265 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 UBR7Q8N806 425 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ATL2Q8NHH9 583 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TCEA3O75764 348 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 USP37Q86T82 979 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 SGSM3Q96HU1 749 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 GGT7Q9UJ14 662 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TCP11X1B4DZS4 312 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CLTAP09496 248 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 GNA15P30679 374 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 GJC1P36383 396 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ADCY8P40145 1251 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 PARP9Q8IXQ6 854 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM11Q96F44 468 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 FAM81BQ96LP2 452 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 OSBPL8Q9BZF1 889 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 LGALS13Q9UHV8 139 aa14.19□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.18□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.18□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 PIGRP01833 764 aa14.18□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF132P52740 706 aa14.18□□□□□ -0.14
C9orf170-201ENST00000623052 CCNG2Q16589 344 aa14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms