RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 NELL2Q99435 816 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa27.23■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF197O14709 1029 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 MAPTP10636 758 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 FCARP24071 287 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 SMTNP53814 917 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 SEZ6Q53EL9 994 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 ZPBP2Q6X784 338 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 KCTD17Q8N5Z5 321 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
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PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 PNMA5Q96PV4 448 aa27.22■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 TARSP26639 723 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
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PTPRF-216ENST00000617451 CCR2P41597 374 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 MCL1Q07820 350 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF280DQ6N043 979 aa27.21■■□□□ 1.95
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PTPRF-216ENST00000617451 RUBCNQ92622 972 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 DDX12PQ92771 950 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 BORCS6Q96GS4 357 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 HEBP1Q9NRV9 189 aa27.21■■□□□ 1.95
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PTPRF-216ENST00000617451 F5P12259 2224 aa27.2■■□□□ 1.95
PTPRF-216ENST00000617451 CLDN3O15551 220 aa27.2■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 KINO60870 393 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 ADCY1Q08828 1119 aa27.2■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 RILPL1Q5EBL4 403 aa27.2■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 FAM78AQ5JUQ0 283 aa27.2■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF852Q6ZMS4 543 aa27.2■■□□□ 1.94
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PTPRF-216ENST00000617451 ZFP14Q9HCL3 533 aa27.2■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHB8Q9UN66 801 aa27.2■■□□□ 1.94
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PTPRF-216ENST00000617451 CYP4A22Q5TCH4 519 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 ELMOD1Q8N336 334 aa27.19■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 RMDN1Q96DB5 314 aa27.19■■□□□ 1.94
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PTPRF-216ENST00000617451 PATJQ8NI35 1801 aa27.18■■□□□ 1.94
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PTPRF-216ENST00000617451 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
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PTPRF-216ENST00000617451 CEP72Q9P209 647 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 KIF3AQ9Y496 699 aa27.18■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa27.18■■□□□ 1.94
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PTPRF-216ENST00000617451 TTC26A0AVF1 554 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 M0QZQ0 153 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 SPTLC1O15269 473 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 MOSPD3O75425 235 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 CLTAP09496 248 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 PLA2G4BP0C869 781 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 CXCL8P10145 99 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 TWF1Q12792 350 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 GRM2Q14416 872 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 HS6ST3Q8IZP7 471 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM130Q8N3G9 435 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 DCLK2Q8N568 766 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 ZSWIM3Q96MP5 696 aa27.17■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 OAZ2O95190 189 aa27.16■■□□□ 1.94
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PTPRF-216ENST00000617451 LEMD2Q8NC56 503 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 BEST2Q8NFU1 509 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 SMARCD2Q92925 531 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 KCNN1Q92952 543 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 BRD9Q9H8M2 597 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 MYH11P35749 1972 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 VWA3AA6NCI4 1184 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 CPB1P15086 417 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRF-216ENST00000617451 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP27.15■■□□□ 1.942e-6■■■□□ 15.7
PTPRF-216ENST00000617451 NCKAP1LP55160 1127 aa27.15■■□□□ 1.94
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