RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 TUSC3Q13454 348 aa22.54■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.54■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 PLCB1Q9NQ66 1216 aa22.54■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.54■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.54■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.54■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.54■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.53■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 F8W810 466 aa22.53■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 RBP5P82980 135 aa22.53■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 LRMPQ12912 555 aa22.53■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 SHHQ15465 462 aa22.53■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.53■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 URGCPQ8TCY9 931 aa22.53■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 KAT5Q92993 513 aa22.53■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 CWH43Q9H720 699 aa22.53■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.53■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 GJB5O95377 273 aa22.52■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 KRT19P08727 400 aa22.52■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 CLCNKBP51801 687 aa22.52■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 UPP1Q16831 310 aa22.52■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 TMC6Q7Z403 805 aa22.52■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.52■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.52■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.52■■□□□ 1.2
CSAG3-202ENST00000617158 TPM3P06753 285 aa22.51■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00271P0C7V0 271 aa22.51■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.51■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 IQCEQ6IPM2 695 aa22.51■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.51■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 ABI1Q8IZP0 508 aa22.51■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.51■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 HPDLQ96IR7 371 aa22.51■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.51■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.51■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 POLIQ9UNA4 740 aa22.51■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 GBF1Q92538 1859 aa22.5■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 PODXLO00592 558 aa22.5■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 GYPCP04921 128 aa22.5■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 ITGB1P05556 798 aa22.5■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 RPL9P32969 192 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 TRPC3Q13507 836 aa22.5■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.5■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 BAP1Q92560 729 aa22.5■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 SLC9A7Q96T83 725 aa22.5■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 ARID3AQ99856 593 aa22.5■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 UCHL3P15374 230 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 ATICP31939 592 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 SLC11A1P49279 550 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 LILRA4P59901 499 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 CETN1Q12798 172 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 FIGNQ5HY92 759 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 RRAGAQ7L523 313 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 LIMS2Q7Z4I7 341 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 LRRC43Q8N309 656 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 UBR7Q8N806 425 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 RSPH1Q8WYR4 309 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 TAF4BQ92750 862 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 NT5C1BQ96P26 610 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 GPR88Q9GZN0 384 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 SDCBP2Q9H190 292 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 KIF4AO95239 1232 aa22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 GALTP07902 379 aa22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 PBX3P40426 434 aa22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 ASPAP45381 313 aa22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF699Q32M78 642 aa22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 SPC24Q8NBT2 197 aa22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 NEK11Q8NG66 645 aa22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 UROC1Q96N76 676 aa22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 MARCH5Q9NX47 278 aa22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.48■■□□□ 1.19
CSAG3-202ENST00000617158 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms