RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 CFAP99D6REC4 459 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 TRAPPC3O43617 180 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 TRIM49P0CI25 452 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 TRIM49CP0CI26 452 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CLK1P49759 484 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 HIF1AQ16665 826 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PROSER3Q2NL68 480 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SP8Q8IXZ3 490 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 DNAAF3Q8N9W5 541 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 RNF139Q8WU17 664 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 MAGED4Q96JG8 741 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 TRIM51Q9BSJ1 452 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 KCND2Q9NZV8 630 aa7.22□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 USP17L8P0C7I0 530 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CRKP46108 304 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 ARPC4P59998 168 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 DYNLT1P63172 113 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 GPS1Q13098 491 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SUSD4Q5VX71 490 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 LRRC39Q96DD0 335 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 MAGEB5Q9BZ81 275 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SAR1AQ9NR31 198 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 MPP6Q9NZW5 540 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 AURKCQ9UQB9 309 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 GOLGA8MH3BSY2 632 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 VCPP55072 806 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CDK17Q00537 523 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 TRIM69Q86WT6 500 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 CD302Q8IX05 232 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 RHOT1Q8IXI2 618 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 BEST2Q8NFU1 509 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 TUFT1Q9NNX1 390 aa7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CLCN3-211ENST00000613795 USP32Q8NFA0 1604 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SRP72O76094 671 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 BCL10O95999 233 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RIPK1Q13546 671 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ITGA9Q13797 1035 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ELMOD1Q8N336 334 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 URGCPQ8TCY9 931 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ABCF3Q9NUQ8 709 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TAGLN3Q9UI15 199 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 GMEB1Q9Y692 573 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ZHX2Q9Y6X8 837 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TSPOAP1O95153 1857 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 CYP4A11Q02928 519 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.267e-6■■□□□ 12.8
CLCN3-211ENST00000613795 KCNH2Q12809 1159 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 SLC29A2Q14542 456 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 STILQ15468 1287 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 EFHC1Q5JVL4 640 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TMEM63BQ5T3F8 832 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ERICH1Q86X53 443 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF786Q8N393 782 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ISCA1Q9BUE6 129 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TEX12Q9BXU0 123 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 COG4Q9H9E3 785 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 GTSE1Q9NYZ3 720 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 COPG2Q9UBF2 871 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PNPLA6Q8IY17 1366 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ASB14A6NK59 587 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 K7ERI5 159 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 NFIBO00712 420 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 PSMD3O43242 534 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 TNFRSF8P28908 595 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ATP1A4Q13733 1029 aa7.21□□□□□ -1.26
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF667Q5HYK9 610 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms