RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	RAB21	Q9UL25	225 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ADGRA3	Q8IWK6	1321 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	TTI1	O43156	1089 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	STRN	O43815	780 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ACSL3	O95573	720 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT10	P13645	584 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GLRA2	P23416	452 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	EML3	Q32P44	896 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	TRIM58	Q8NG06	486 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	NT5C1B	Q96P26	610 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	OSMR	Q99650	979 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	PTPN18	Q99952	460 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF233	A6NK53	670 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CXCL8	P10145	99 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	KRT35	Q92764	455 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CALN1	Q9BXU9	219 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	RLF	Q13129	1914 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	E2F8	A0AVK6	867 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	SOCS7	O14512	581 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	HCRT	O43612	131 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	STBD1	O95210	358 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	NPTXR	O95502	500 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GH1	P01241	217 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM153B	P0C7A2	387 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	RFC5	P40937	340 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	NRL	P54845	237 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM153C	Q494X1	144 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	IL31	Q6EBC2	164 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	FGD4	Q96M96	766 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	DMAC2	Q9NW81	257 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	MYH11	P35749	1972 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232		I3L4J1	428 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	WNT7B	P56706	349 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GNGT1	P63211	74 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	NAGPA	Q9UK23	515 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	AMFR	Q9UKV5	643 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232		O00370	1275 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	NDUFAB1	O14561	156 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ATG7	O95352	703 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	PDE6C	P51160	858 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	LAMC2	Q13753	1193 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GPD1L	Q8N335	351 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	STKLD1	Q8NE28	680 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	HSPH1	Q92598	858 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GAN	Q9H2C0	597 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	DONSON	Q9NYP3	566 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		10.47	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	10.46	□□□□□ -0.73	8e-11	■■■■□ 20.5
CTCFL-222	ENST00000609232	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ADSS	P30520	456 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	NAMPT	P43490	491 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	BCAR1	P56945	870 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC142	Q17RM4	750 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CAND2	O75155	1236 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GLI1	P08151	1106 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	FECH	P22830	423 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	MAPK4	P31152	587 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	MYL6	P60660	151 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		10.46	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		10.46	□□□□□ -0.73

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