RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 GLT1D1Q96MS3 346 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ISCUQ9H1K1 167 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 CNTN3Q9P232 1028 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 SALL4Q9UJQ4 1053 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PHF24Q9UPV7 400 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 MACROD2A1Z1Q3 448 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT5P13647 590 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PDE6CP51160 858 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 FMO1Q01740 532 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 NOX5Q96PH1 765 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ANO9A1A5B4 782 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 RPS6KA5O75582 802 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM253P0C7T8 217 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.41■■□□□ 1.52e-11■■■□□ 17.4
CAPNS1-207ENST00000589146 ASPAP45381 313 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 RBP5P82980 135 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TCEAL1Q15170 157 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHB18PQ96TA0 734 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 BCO2Q9BYV7 579 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 DPP3Q9NY33 737 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 SQORQ9Y6N5 450 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 NCANO14594 1321 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 RTN2O75298 545 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 URI1O94763 535 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 MOCS3O95396 460 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGB3P05106 788 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNE1P15382 129 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 GALCP54803 685 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PALB2Q86YC2 1186 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF12Q96FN5 646 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 BEGAINQ9BUH8 593 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PQY0 241 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD62A6NC57 917 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR182O15218 404 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 RECQL4O94761 1208 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 THPOP40225 353 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF667Q5HYK9 610 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO47Q5MNV8 452 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 ALS2CR12Q96Q35 445 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP3A43Q9HB55 503 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 IPPQ9Y573 584 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 MRFAP1Q9Y605 127 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 MMEP08473 750 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT19P08727 400 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 AMPD2Q01433 879 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAIPQ9BWF2 469 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 ACP6Q9NPH0 428 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CISHQ9NSE2 258 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TAS2R14Q9NYV8 317 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 JRKLQ9Y4A0 524 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 HES2Q9Y543 173 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CTSHP09668 335 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TAF3Q5VWG9 929 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM270Q6UE05 265 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM72Q6ZMU5 477 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 USP38Q8NB14 1042 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 BEST2Q8NFU1 509 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 WBP1LQ9NX94 342 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TSKSQ9UJT2 592 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC23Q9UJX2 597 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 AGAP1Q9UPQ3 857 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 FTLP02792 175 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 P4HA1P13674 534 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP3A5P20815 502 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 RFFLQ8WZ73 363 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 HPDLQ96IR7 371 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CXCL16Q9H2A7 254 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF39Q9H2S5 420 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-207ENST00000589146 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
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