RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559359.1

PSME2-208, Transcript of proteasome activator subunit 2, human

TSL 2

Gene PSME2, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME2-208	ENST00000559359	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	CHST7	Q9NS84	486 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	STK39	Q9UEW8	545 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	NR2E1	Q9Y466	385 aa		11.44	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	PLXNA3	P51805	1871 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	LILRA1	O75019	489 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	GUCY2C	P25092	1073 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	PLA2G5	P39877	138 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	SLC12A3	P55017	1021 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	CUL4A	Q13619	759 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	HYI	Q5T013	277 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	LRRC15	Q8TF66	581 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	TCHP	Q9BT92	498 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	GOLGA2P5	Q9HBQ8	144 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		11.43	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	11.42	□□□□□ -0.58	5e-6	■■■■■ 114.9
PSME2-208	ENST00000559359	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359		I3L4J1	428 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	TGM5	O43548	720 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	PLS3	P13797	630 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	UBA7	P41226	1012 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	SEZ6	Q53EL9	994 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	ARSH	Q5FYA8	562 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	GPBP1	Q86WP2	473 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	MYO10	Q9HD67	2058 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	ABLIM1	O14639	778 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	ADAM12	O43184	909 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	B3GAT3	O94766	335 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	BRD1	O95696	1058 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	PLCG1	P19174	1290 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	CLCNKB	P51801	687 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	STRN3	Q13033	797 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	MCM6	Q14566	821 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	PSMD5	Q16401	504 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	SPECC1	Q5M775	1068 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	CALML4	Q96GE6	196 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	BACH2	Q9BYV9	841 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	CYLD	Q9NQC7	956 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	CLIC4	Q9Y696	253 aa		11.41	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	TRIP11	Q15643	1979 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	MCF2	P10911	925 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	PROZ	P22891	400 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	BRCC3	P46736	316 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	SMTN	P53814	917 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	LILRA6	Q6PI73	481 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	USP49	Q70CQ1	688 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
PSME2-208	ENST00000559359	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58

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