RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554184.5

CCNB1IP1-210, Transcript of cyclin B1 interacting protein 1, human

TSL 3

Gene CCNB1IP1, Length 513 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CCDC93	Q567U6	631 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SMC5	Q8IY18	1101 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SGCZ	Q96LD1	299 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC6A2	P23975	617 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KCNJ5	P48544	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CASP5	P51878	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CLRN1	P58418	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PTH1R	Q03431	593 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DUSP8	Q13202	625 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ZNF536	O15090	1300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	POM121B	A6NF01	834 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RASA4B	C9J798	803 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TEX33	O43247	280 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RASA4	O43374	803 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FRS3	O43559	492 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SLC43A1	O75387	559 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PRSS23	O95084	383 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GJB1	P08034	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TNFSF4	P23510	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GRM7	Q14831	915 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	NFIX	Q14938	502 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BTN3A1	O00481	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GPR42	O15529	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	AGFG2	O95081	481 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	POMC	P01189	267 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ITGB3	P05106	788 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	HK1	P19367	917 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ABCB4	P21439	1286 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	STT3A	P46977	705 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ARFIP2	P53365	341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	KIF22	Q14807	665 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	MAML1	Q92585	1016 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BORCS6	Q96GS4	357 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCNB1IP1-210	ENST00000554184	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms