RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	TCHH	Q07283	1943 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222		I3L4J1	428 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	SPTLC2	O15270	562 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	PPP6R2	O75170	966 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	MED24	O75448	989 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	LYPLA2	O95372	231 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	RPA1	P27694	616 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CDC25A	P30304	524 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CCR3	P51677	355 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	KRT85	P78386	507 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CYP4A11	Q02928	519 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	VIT	Q6UXI7	678 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	TPH2	Q8IWU9	490 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	AK8	Q96MA6	479 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		15.18	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	IGF2R	P11717	2491 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222		A0A087WWV3	80 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	XYLB	O75191	536 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	MUT	P22033	750 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	AMHR2	Q16671	573 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	KBTBD6	Q86V97	674 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CEP170P1	Q96L14	293 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CSRNP2	Q9H175	543 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	WASF3	Q9UPY6	502 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	F5	P12259	2224 aa		15.17	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	VWA8	A3KMH1	1905 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	NR1I2	O75469	434 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	ERLIN2	O94905	339 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	ECM1	Q16610	540 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	PRSS36	Q5K4E3	855 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	KRT79	Q5XKE5	535 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	LONP2	Q86WA8	852 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CLIC6	Q96NY7	704 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CORO1B	Q9BR76	489 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	LHX6	Q9UPM6	363 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		15.16	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	15.16	■□□□□ 0.02	2e-6	■■■■■ 114.2
CS-231	ENST00000552222	AKAP13	Q12802	2813 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	PTGES	O14684	152 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	SLC26A4	O43511	780 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	EXTL3	O43909	919 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	C1R	P00736	705 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	HOXA9	P31269	272 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	RAB33A	Q14088	237 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	EMC2	Q15006	297 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	HYI	Q5T013	277 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	KDF1	Q8NAX2	398 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	SPATA32	Q96LK8	384 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	SNTG2	Q9NY99	539 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		15.15	■□□□□ 0.02
CS-231	ENST00000552222	MAN2B1	O00754	1011 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	CUTA	O60888	179 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	MOSPD3	O75425	235 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	SEC24A	O95486	1093 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	15.14	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	UBA7	P41226	1012 aa		15.14	■□□□□ 0.01
CS-231	ENST00000552222	ME1	P48163	572 aa		15.14	■□□□□ 0.01

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