RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	PTGDR	Q13258	359 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	IL17A	Q16552	155 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	DNASE1L2	Q92874	299 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ACAP3	Q96P50	834 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	NELL2	Q99435	816 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	NCDN	Q9UBB6	729 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		13.77	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	SFI1	A8K8P3	1242 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931		H7C4K7	107 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC16A4	O15374	487 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	LILRB5	O75023	590 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MOSPD3	O75425	235 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ADCY1	Q08828	1119 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MTAP	Q13126	283 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	PDIA5	Q14554	519 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	SEZ6	Q53EL9	994 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TPGS2	Q68CL5	300 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	VIT	Q6UXI7	678 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	SUSD3	Q96L08	255 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	DRC1	Q96MC2	740 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ASB16	Q96NS5	453 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TCHP	Q9BT92	498 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	EPC1	Q9H2F5	836 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	BRD9	Q9H8M2	597 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	CEP72	Q9P209	647 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.76	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF197	O14709	1029 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	NCAM2	O15394	837 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MICAL2	O94851	1124 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	GJA1	P17302	382 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MCM4	P33991	863 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TWF1	Q12792	350 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF280D	Q6N043	979 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	DDX12P	Q92771	950 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		13.75	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	EML5	Q05BV3	1969 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	VNN2	O95498	520 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MYL4	P12829	197 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TDGF1	P13385	188 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	GDI1	P31150	447 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	VIPR2	P41587	438 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	EPHA5	P54756	1037 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	SPAG1	Q07617	926 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT79	Q5XKE5	535 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	SMARCD2	Q92925	531 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	BORCS6	Q96GS4	357 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	RAB34	Q9BZG1	259 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	CHRD	Q9H2X0	955 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	STK24	Q9Y6E0	443 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	TOM1L1	O75674	476 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	CXCL8	P10145	99 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	CPB1	P15086	417 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LETMD1-231	ENST00000551931	PSMC3	P17980	439 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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