RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519815.5

TRPS1-210, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-210ENST00000519815 PI4K2AQ9BTU6 479 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 APOL6Q9BWW8 343 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 FAM105AQ9NUU6 356 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 CNTN3Q9P232 1028 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 LHX6Q9UPM6 363 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
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TRPS1-210ENST00000519815 CCP110O43303 1012 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 ZNF623O75123 536 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 RECQL4O94761 1208 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 ASS1P00966 412 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 SKIP12755 728 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 ITGA4P13612 1032 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 AKAP5P24588 427 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
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TRPS1-210ENST00000519815 ARID5AQ03989 594 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 XKR4Q5GH76 650 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
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TRPS1-210ENST00000519815 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.614e-9■■■■■ 223.6
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TRPS1-210ENST00000519815 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
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TRPS1-210ENST00000519815 A0A0U1RQF3 1178 aa11.21□□□□□ -0.61
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TRPS1-210ENST00000519815 ZSCAN12O43309 604 aa11.21□□□□□ -0.61
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TRPS1-210ENST00000519815 CLSTN1O94985 981 aa11.21□□□□□ -0.61
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TRPS1-210ENST00000519815 C11orf49Q9H6J7 331 aa11.21□□□□□ -0.61
TRPS1-210ENST00000519815 PRDM10Q9NQV6 1147 aa11.21□□□□□ -0.61
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TRPS1-210ENST00000519815 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 SPOPLQ6IQ16 392 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 VPS36Q86VN1 386 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 FAM71AQ8IYT1 594 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPS1-210ENST00000519815 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
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