RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516637.1

RNU6-405P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 405, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-405P, Length 110 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-405P-201ENST00000516637 SBK3P0C264 359 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 ABCB5Q2M3G0 1257 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 SYCE2Q6PIF2 218 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 RSPH3Q86UC2 560 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 COLGALT2Q8IYK4 626 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 Q8NA96 180 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 IFI44Q8TCB0 444 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 FAXDC2Q96IV6 333 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 TLR10Q9BXR5 811 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 KCTD5Q9NXV2 234 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 PCDHGA12O60330 932 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 AGFG2O95081 481 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 MYBL2P10244 700 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 SLC16A1P53985 500 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 C21orf58P58505 322 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 CDC42EP1Q00587 391 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 IL10RAQ13651 578 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 SYDE2Q5VT97 1194 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 LNX2Q8N448 690 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 ACTRT2Q8TDY3 377 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 SSH3Q8TE77 659 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 HDAC10Q969S8 669 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 DUSP26Q9BV47 211 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 KIAA1586Q9HCI6 787 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 FOXJ2Q9P0K8 574 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 TRHDEQ9UKU6 1024 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 DMTF1Q9Y222 760 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 IPPQ9Y573 584 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 KLHL33A6NCF5 533 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 EDNRBP24530 442 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 CD38P28907 300 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 RARRES1P49788 294 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 MTMR1Q13613 665 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 CDYLQ9Y232 598 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 CCDC154A6NI56 674 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 FZD9O00144 591 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 SGTAO43765 313 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 IL12RB1P42701 662 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 GUCY2FP51841 1108 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 ITKQ08881 620 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 FLYWCH1Q4VC44 716 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 IL17RDQ8NFM7 739 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 KAT5Q92993 513 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 TMEM125Q96AQ2 219 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 MTMR8Q96EF0 704 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 PDLIM2Q96JY6 352 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 MRGPRX4Q96LA9 322 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 TEKT5Q96M29 485 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 LRFN3Q9BTN0 628 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 PACSIN1Q9BY11 444 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 SLC45A2Q9UMX9 530 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 A0A1W2PS29 197 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 GABRDO14764 452 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 PEX1O43933 1283 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 KATNA1O75449 491 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 CD1AP06126 327 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 RAB39AQ14964 217 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 COLEC12Q5KU26 742 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 GADL1Q6ZQY3 521 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 ARHGEF25Q86VW2 580 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 NELL1Q92832 810 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 COA7Q96BR5 231 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-405P-201ENST00000516637 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms