RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516553.1

RNU6-506P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 506, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-506P, Length 94 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-506P-201ENST00000516553 CNTD1Q8N815 330 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 ACTRT2Q8TDY3 377 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 SSH3Q8TE77 659 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 TMX1Q9H3N1 280 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 SEMA4GQ9NTN9 838 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 TUBD1Q9UJT1 453 aa4.75□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 HAUS5O94927 633 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 CACNA2D1P54289 1103 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 CLUL1Q15846 466 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 JADE3Q92613 823 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 TDP1Q9NUW8 608 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 SLC5A4Q9NY91 659 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 MCM8Q9UJA3 840 aa4.74□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 A0A1W2PS29 197 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 NDUFS2O75306 463 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 C1QL1O75973 258 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 MATN4O95460 622 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 C1RP00736 705 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 LMO1P25800 156 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 CDC42EP1Q00587 391 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 PGM2L1Q6PCE3 622 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 MIGA2Q7L4E1 593 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 ARHGEF25Q86VW2 580 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 IFI44Q8TCB0 444 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 RAB24Q969Q5 203 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 TMX3Q96JJ7 454 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 TLR10Q9BXR5 811 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa4.73□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 GRM6O15303 877 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 PEX1O43933 1283 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 AGFG2O95081 481 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 SBK3P0C264 359 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 C5AR1P21730 350 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 IARSP41252 1262 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 FOLR3P41439 243 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 NHLH1Q02575 133 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 KIAA0895LQ68EN5 471 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 VWA1Q6PCB0 445 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 NECAB2Q7Z6G3 386 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 RSPH3Q86UC2 560 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 IL17RDQ8NFM7 739 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 MKS1Q9NXB0 559 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 SLC17A6Q9P2U8 582 aa4.72□□□□□ -1.65
RNU6-506P-201ENST00000516553 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 SGTAO43765 313 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 PRAMEF10O60809 474 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 SRGNP10124 158 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 KCNA2P16389 499 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 SLC16A1P53985 500 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 CLNKQ7Z7G1 428 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZNF384Q8TF68 577 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 HDAC10Q969S8 669 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 TMEM125Q96AQ2 219 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 FAXDC2Q96IV6 333 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 KLK15Q9H2R5 256 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 JKAMPQ9P055 326 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 IPPQ9Y573 584 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 YY2O15391 372 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 PROM1O43490 865 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 PCDHGA12O60330 932 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 SLC43A1O75387 559 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 MT-CO1P00395 513 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 GATA3P23771 443 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 EDNRBP24530 442 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 RPS7P62081 194 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 IL10RAQ13651 578 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 ACAP2Q15057 778 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 FLYWCH1Q4VC44 716 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 LRCH2Q5VUJ6 765 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 MRGPRX4Q96LA9 322 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 KLHL32Q96NJ5 620 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 INTS13Q9NVM9 706 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 CDYLQ9Y232 598 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-506P-201ENST00000516553 NEU2Q9Y3R4 380 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms