RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 FLOT1O75955 427 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 RASGRP1O95267 797 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 MED26O95402 600 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 MMP1P03956 469 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 SLC16A2P36021 539 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 HMGCS2P54868 508 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 KRT85P78386 507 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 PAK1Q13153 545 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 SNAPC2Q13487 334 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 COG2Q14746 738 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 PKN1Q16512 942 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 MBLAC2Q68D91 279 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 Q7L0L9 218 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CUL5Q93034 780 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 AMNQ9BXJ7 453 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 TMEM59LQ9UK28 342 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa8.24□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 MYH8P13535 1937 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 ESYT2A0FGR8 921 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 SMCO2A6NFE2 343 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CYTH3O43739 400 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CETPP11597 493 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 VCAM1P19320 739 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 ITGB7P26010 798 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CNGA1P29973 690 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 ADCY7P51828 1080 aa8.23□□□□□ -1.09
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HERC3-210ENST00000512194 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 LSAMPQ13449 338 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 FERMT3Q86UX7 667 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 JAMLQ86YT9 394 aa8.23□□□□□ -1.09
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HERC3-210ENST00000512194 BLIDQ8IZY5 108 aa8.23□□□□□ -1.09
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HERC3-210ENST00000512194 MTMR8Q96EF0 704 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 KCNJ14Q9UNX9 436 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 MUC3AQ02505 3323 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 MYPNQ86TC9 1320 aa8.23□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CDH23Q9H251 3354 aa8.22□□□□□ -1.09
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HERC3-210ENST00000512194 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa8.22□□□□□ -1.09
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HERC3-210ENST00000512194 BMP15O95972 392 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 FUT4P22083 530 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CORO7P57737 925 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CHRNEQ04844 493 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 PKP1Q13835 747 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 ZNF460Q14592 562 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CCL15Q16663 113 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 RILPL1Q5EBL4 403 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 WWC2Q6AWC2 1192 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.22□□□□□ -1.09
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HERC3-210ENST00000512194 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
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HERC3-210ENST00000512194 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 MB21D1Q8N884 522 aa8.22□□□□□ -1.09
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HERC3-210ENST00000512194 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 CPVLQ9H3G5 476 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 PSTPIP2Q9H939 334 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 ABCB11O95342 1321 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 PLXNB2O15031 1838 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-210ENST00000512194 TTC28Q96AY4 2481 aa8.21□□□□□ -1.09
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