RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 DLATP10515 647 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 CD44P16070 742 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 IRS1P35568 1242 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 CLDN10P78369 228 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL10Q6JEL2 608 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM186BQ8IYM0 893 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 MICALL1Q8N3F8 863 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 PARD3BQ8TEW8 1205 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 HASPINQ8TF76 798 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC127Q96BQ5 260 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 F8W810 466 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 IKBKBO14920 756 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 AKAP3O75969 853 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 NLRP12P59046 1061 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 RBP5P82980 135 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM171A1Q5VUB5 890 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRC52Q8N7C0 313 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 C3orf58Q8NDZ4 430 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 APPL2Q8NEU8 664 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 SUSD3Q96L08 255 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 TLE6Q9H808 572 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 MYO7AQ13402 2215 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 C2orf71A6NGG8 1288 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 CASP4P49662 377 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 TAF6P49848 677 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 WNT7BP56706 349 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 PTPN14Q15678 1187 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 SV2CQ496J9 727 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 TCEAL5Q5H9L2 206 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 KIAA0319Q5VV43 1072 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 CD300LGQ6UXG3 332 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 PPFIBP1Q86W92 1011 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 MTMR12Q9C0I1 747 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 RWDD2AQ9UIY3 292 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 CTNND2Q9UQB3 1225 aa28.96■■■□□ 2.23
SH3BP2-212ENST00000508338 C1RP00736 705 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 SRGAP2BP0DMP2 458 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 FGFR3P22607 806 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 CA8P35219 290 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 VAMP7P51809 220 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 LILRA4P59901 499 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 KLHL40Q2TBA0 621 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 TTI2Q6NXR4 508 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKS3Q6ZW76 656 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 C1orf127Q8N9H9 656 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 PIK3R5Q8WYR1 880 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 FNIP2Q9P278 1114 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 M0QZQ0 153 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 STX10O60499 249 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 GNA14O95837 355 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 ITGB3P05106 788 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 GUCY2FP51841 1108 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 PMS1P54277 932 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 BFSP1Q12934 665 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 MYO1EQ12965 1108 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 SASS6Q6UVJ0 657 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 RXFP1Q9HBX9 757 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHB8Q9UN66 801 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM49BA6NDI0 452 aa28.93■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 LILRB3O75022 631 aa28.93■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 CSPG5O95196 566 aa28.93■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 DUSP6Q16828 381 aa28.93■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 DSTYKQ6XUX3 929 aa28.93■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 TAS1R1Q7RTX1 841 aa28.93■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa28.93■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 CEP57Q86XR8 500 aa28.93■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 OR5B17Q8NGF7 314 aa28.93■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 DSEQ9UL01 958 aa28.93■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 AGAP1Q9UPQ3 857 aa28.93■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 HIDE1A8MVS5 230 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 H7C4K7 107 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 ADH1AP07327 375 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT19P08727 400 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 ODC1P11926 461 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 GTF2H1P32780 548 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 BRCC3P46736 316 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 EFHBQ8N7U6 833 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 COG5Q9UP83 839 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 TYMPP19971 482 aa28.91■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 NRIP1P48552 1158 aa28.91■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 COL19A1Q14993 1142 aa28.91■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa28.91■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 FRMD5Q7Z6J6 570 aa28.91■■■□□ 2.22
SH3BP2-212ENST00000508338 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms