RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 RUBCNQ92622 972 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 RMDN1Q96DB5 314 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 CORO1BQ9BR76 489 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.75■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 KINO60870 393 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 TOM1L1O75674 476 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 ARPP19P56211 112 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 SLC10A6Q3KNW5 377 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 HYIQ5T013 277 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 DTHD1Q6ZMT9 781 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 DNASE1L2Q92874 299 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 TCEAL4Q96EI5 215 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 NELL2Q99435 816 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 HEBP1Q9NRV9 189 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 CEP250Q9BV73 2442 aa21.74■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 SFI1A8K8P3 1242 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 ZNF197O14709 1029 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 SPTLC1O15269 473 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 HARSP12081 509 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 CCR2P41597 374 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 RPS9P46781 194 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 FZD5Q13467 585 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 ZNF280DQ6N043 979 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 DDX12PQ92771 950 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 NELL1Q92832 810 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 MAFFQ9ULX9 164 aa21.73■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 F5P12259 2224 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 PLS3P13797 630 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 MCM4P33991 863 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 STRN3Q13033 797 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 FAM78AQ5JUQ0 283 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 ZPBP2Q6X784 338 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 ZNF852Q6ZMS4 543 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 DCLK2Q8N568 766 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 APPL2Q8NEU8 664 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 ASB16Q96NS5 453 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 PNMA5Q96PV4 448 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 HINFPQ9BQA5 517 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 KCNG1Q9UIX4 513 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.72■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 NCAM2O15394 837 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 MOSPD3O75425 235 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 MCL1Q07820 350 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 SEZ6Q53EL9 994 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 ZNF687Q8N1G0 1237 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 ZFP14Q9HCL3 533 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 CEP72Q9P209 647 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.71■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
NELFE-212ENST00000492539 M0QZQ0 153 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 LRPAP1P30533 357 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 SMTNP53814 917 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 EPHA5P54756 1037 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 ADCY1Q08828 1119 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 GRM2Q14416 872 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 CYP4A22Q5TCH4 519 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 IQCEQ6IPM2 695 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 ELMOD1Q8N336 334 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 BEST2Q8NFU1 509 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 KCNN1Q92952 543 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 KCND2Q9NZV8 630 aa21.7■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 LILRB5O75023 590 aa21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 CXCL8P10145 99 aa21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 SLC12A3P55017 1021 aa21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 TWF1Q12792 350 aa21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 MAP4K3Q8IVH8 894 aa21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 LEMD2Q8NC56 503 aa21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 SNX21Q969T3 373 aa21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 BRD9Q9H8M2 597 aa21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 TRPV5Q9NQA5 729 aa21.69■■□□□ 1.06
NELFE-212ENST00000492539 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms