RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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USP40-215ENST00000484528 ZNF131P52739 623 aa23.48■■□□□ 1.35
USP40-215ENST00000484528 PPP2R3AQ06190 1150 aa23.48■■□□□ 1.35
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USP40-215ENST00000484528 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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USP40-215ENST00000484528 INSL5Q9Y5Q6 135 aa23.47■■□□□ 1.35
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USP40-215ENST00000484528 XPOTO43592 962 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
USP40-215ENST00000484528 NFICP08651 508 aa23.42■■□□□ 1.34
USP40-215ENST00000484528 SYT1P21579 422 aa23.42■■□□□ 1.34
USP40-215ENST00000484528 CCR2P41597 374 aa23.42■■□□□ 1.34
USP40-215ENST00000484528 GTF2BQ00403 316 aa23.42■■□□□ 1.34
USP40-215ENST00000484528 TWF1Q12792 350 aa23.42■■□□□ 1.34
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