RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477448.1

SOBP-202, Transcript of sine oculis binding protein homolog, humanhuman

TSL 5

Gene SOBP, Length 1,535 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBP-202ENST00000477448 MLH1P40692 756 aa27.89■■■□□ 2.06
SOBP-202ENST00000477448 NCOA4Q13772 614 aa27.89■■■□□ 2.06
SOBP-202ENST00000477448 ARID5BQ14865 1188 aa27.89■■■□□ 2.06
SOBP-202ENST00000477448 RAB30Q15771 203 aa27.89■■■□□ 2.06
SOBP-202ENST00000477448 SCARA3Q6AZY7 606 aa27.89■■■□□ 2.06
SOBP-202ENST00000477448 TC2NQ8N9U0 490 aa27.89■■■□□ 2.06
SOBP-202ENST00000477448 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa27.89■■■□□ 2.06
SOBP-202ENST00000477448 ZFP42Q96MM3 310 aa27.89■■■□□ 2.06
SOBP-202ENST00000477448 SCN1AP35498 2009 aa27.89■■■□□ 2.06
SOBP-202ENST00000477448 PTGESO14684 152 aa27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 EOMESO95936 686 aa27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 CST3P01034 146 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 ADKP55263 362 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 RNF169Q8NCN4 708 aa27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 GSTCDQ8NEC7 633 aa27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 CXorf38Q8TB03 319 aa27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 GAD1Q99259 594 aa27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 RSAD1Q9HA92 442 aa27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 UBN1Q9NPG3 1134 aa27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 RNF19AQ9NV58 838 aa27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 FHOD1Q9Y613 1164 aa27.88■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 LRMPQ12912 555 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 FAM117BQ6P1L5 589 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 GJB7Q6PEY0 223 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 CNGA4Q8IV77 575 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 TMEM130Q8N3G9 435 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 CCDC150Q8NCX0 1101 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 MYLIPQ8WY64 445 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 PI4K2AQ9BTU6 479 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 DPP3Q9NY33 737 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 SIX4Q9UIU6 781 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 ARL5CA6NH57 179 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 ARHGEF15O94989 841 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 GUCY2FP51841 1108 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 BAP1Q92560 729 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 NT5C1BQ96P26 610 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 RPS6KC1Q96S38 1066 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 NLRC4Q9NPP4 1024 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 ITGA11Q9UKX5 1188 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa27.87■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 TMEM265A0A087WTH1 108 aa27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 ITGB3P05106 788 aa27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 KRT9P35527 623 aa27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 ZBED6P86452 979 aa27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 TRPC3Q13507 836 aa27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 IQCEQ6IPM2 695 aa27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 ARHGEF19Q8IW93 802 aa27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 BEST2Q8NFU1 509 aa27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 SLC28A3Q9HAS3 691 aa27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 TMEM161AQ9NX61 479 aa27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 PLAGL2Q9UPG8 496 aa27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 CHD9Q3L8U1 2897 aa27.86■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 XPOTO43592 962 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 ASS1P00966 412 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 CA3P07451 260 aa27.85■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 RFX1P22670 979 aa27.85■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 MYL6P60660 151 aa27.85■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 WDR44Q5JSH3 913 aa27.85■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 ELMO3Q96BJ8 720 aa27.85■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 MIOSQ9NXC5 875 aa27.85■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 DNAJC12Q9UKB3 198 aa27.85■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 KRT19P08727 400 aa27.84■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 CYP3A5P20815 502 aa27.84■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 TATDN2Q93075 761 aa27.84■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 ABHD10Q9NUJ1 306 aa27.84■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa27.84■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 EYSQ5T1H1 3165 aa27.83■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 LCHNA4D1U4 455 aa27.83■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 INPPL1O15357 1258 aa27.83■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 TLL1O43897 1013 aa27.83■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 EFCAB14O75071 495 aa27.83■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 SCNN1GP51170 649 aa27.83■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 NOP14P78316 857 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa27.83■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 SPOPLQ6IQ16 392 aa27.83■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 SPRED2Q7Z698 418 aa27.83■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 LRRC8AQ8IWT6 810 aa27.83■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 HELQQ8TDG4 1101 aa27.83■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 DNAJC7Q99615 494 aa27.83■■■□□ 2.05
SOBP-202ENST00000477448 ZBED2Q9BTP6 218 aa27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms