RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 ADCY1Q08828 1119 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 TWF1Q12792 350 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 SLC10A6Q3KNW5 377 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 MPZL3Q6UWV2 235 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 VITQ6UXI7 678 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 IGSF22Q8N9C0 903 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 TTC8Q8TAM2 541 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 CLDN23Q96B33 292 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 ACAP3Q96P50 834 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 PNMA5Q96PV4 448 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 GDE1Q9NZC3 331 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 CNTN3Q9P232 1028 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 NCDNQ9UBB6 729 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 DNM3Q9UQ16 869 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 CACNA1BQ00975 2339 aa12.26□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 CITO14578 2027 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 SDK1Q7Z5N4 2213 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 NEFLP07196 543 aa12.25□□□□□ -0.45
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ACTB-209ENST00000473257 GDI1P31150 447 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 TNFSF9P41273 254 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 SOX9P48436 509 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 TEAD2Q15562 447 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 STXBP5Q5T5C0 1151 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 ZNF852Q6ZMS4 543 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 TCEAL8Q8IYN2 117 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 ZNF687Q8N1G0 1237 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 TTC9BQ8N6N2 239 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 FAM184AQ8NB25 1140 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 ATRIPQ8WXE1 791 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 DDX12PQ92771 950 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 ELSPBP1Q96BH3 223 aa12.25□□□□□ -0.45
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ACTB-209ENST00000473257 ASB16Q96NS5 453 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 KIF2CQ99661 725 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 TMEM134Q9H6X4 195 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 BRD9Q9H8M2 597 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 FBXO4Q9UKT5 387 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa12.25□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 CPB1P15086 417 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 MUTP22033 750 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 DMWDQ09019 674 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 PDIA5Q14554 519 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 WDR44Q5JSH3 913 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 KRT79Q5XKE5 535 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 SHKBP1Q8TBC3 707 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 LRRC15Q8TF66 581 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 TMEM209Q96SK2 561 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 OSBPL6Q9BZF3 934 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 ZFP14Q9HCL3 533 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 PARD6AQ9NPB6 346 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 SLC38A7Q9NVC3 462 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 C2orf42Q9NWW7 574 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 ZSCAN32Q9NX65 697 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 PPP4R2Q9NY27 417 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 YIPF1Q9Y548 306 aa12.24□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 COL4A2P08572 1712 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 H7C4K7 107 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 SYN3O14994 580 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 MAPTP10636 758 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 TDGF1P13385 188 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP12.23□□□□□ -0.453e-17■□□□□ 9.4
ACTB-209ENST00000473257 TRAPPC10P48553 1259 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 GAS6Q14393 721 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP12.23□□□□□ -0.455e-11■■■□□ 17.7
ACTB-209ENST00000473257 ZNF528Q3MIS6 628 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 CYP4A22Q5TCH4 519 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 MCTP1Q6DN14 999 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 ZNF280DQ6N043 979 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 MAP4K3Q8IVH8 894 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 ZBTB44Q8NCP5 570 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 SMARCD2Q92925 531 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 KIF12Q96FN5 646 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 ZFYVE19Q96K21 471 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 DRC1Q96MC2 740 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 LRRC3BQ96PB8 259 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 DNAJC25Q9H1X3 360 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 IKZF4Q9H2S9 585 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 LMAN1LQ9HAT1 526 aa12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
ACTB-209ENST00000473257 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
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